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【NBDCヒトデータベース】東北大学大学院 医学系研究科 環境遺伝医学総合研究センター からの制限公開データ(Type I )を公開しました(hum0040)

国際ヒトエピゲノムコンソーシアム(IHEC)に参画する我が国の代表研究チームによる研究 (研究題目:生殖発生にかかわる細胞のエピゲノム解析基盤研究)
からの制限公開データを公開しました。 研究内容はこちら

当該データの利用には、データ利用申請が必要です。申請の際には、NBDCヒトデータ共有ガイドラインおよびNBDCヒトデータ取扱いセキュリティガイドラインを熟読してください。

「トーゴーの日シンポジウム2016 ~統合データベース、実りの時へ~」(2016年10月5日・10月6日)の口頭発表とポスター発表の要旨を公開しました。

「トーゴーの日シンポジウム2016 ~統合データベース、実りの時へ~」(2016年10月5日・10月6日)の口頭発表とポスター発表の要旨を公開しました。

口頭発表(10月5日)
口頭発表(10月6日)
ポスター発表(10月5日・10月6日)

ご参加希望の方はこちらからお申し込みください(申込締切:9月25日(日)まで)。

【生命科学系データベースアーカイブ】「日化辞 InChI対応表」(国立研究開発法人 科学技術振興機構)のデータを更新しました。

「日化辞 InChI対応表」は日本化学物質辞書(日化辞)の化合物IDとInChIおよびInChIKeyの対応に関するデータベースです。

今回の更新では、「InChI対応表」 について、以下のデータ更新を行いました。

  • レコードの統廃合 (3 化合物)
  • InChIおよびInChIKey変更 (3,154 化合物)
  • 新規追加 (89,872 化合物)

日化辞 InChI対応表 アーカイブ

生命科学系データベースアーカイブ

【NBDCヒトデータベース】群馬大学大学院 医学系研究科 病態腫瘍薬理学分野 からの制限公開データ(Type I )を公開しました(hum0064)

研究題目:高齢者がん治療アルゴリズム開発のためのガイドポスト・データベースの構築と必須情報及びその推定モデル
からの制限公開データを公開しました。研究内容はこちら

当該データの利用には、データ利用申請が必要です。申請の際には、NBDCヒトデータ共有ガイドラインおよびNBDCヒトデータ取扱いセキュリティガイドラインを熟読してください。

【生命科学系データベースアーカイブ】「H-InvDB」(東海大学 今西規教授)を追加しました。

「H-InvDB」は、ヒト遺伝子の構造、選択的スプライシングバリアントなどの精査されたアノテーション情報を提供する統合データベースです。

H-InvDB アーカイブ

生命科学系データベースアーカイブ

「トーゴーの日シンポジウム2016 ~統合データベース、実りの時へ~」(2016年10月5日・10月6日)の参加申し込みを開始しました。

 NBDCでは、2011年4月よりわが国のライフサイエンス研究を推進するために、データベースをつなげて使いやすくする事業(ライフサイエンスデータベース統合推進事業)を推進しています。この事業の一環として、NBDCでは、ライフサイエンスデータベースに関するサービス提供と研究開発を行ってきました。特に、研究開発においてはこれまで、1)高度なデータベース検索プラットフォームの構築、新しいツールの提供、さらには、生命科学系コンテンツをウェブ上で分散した状態で統合的に扱うための技術開発、2)分野(ゲノム、プロテオーム、メタボローム、グライコーム、フェノーム等)ごとに産出される情報を網羅的に収集して整理することによって、生命科学のさまざまな領域の知識を集積する生命科学系コンテンツに関するプログラムを支援してきました。
 これらの活動に関する発表を行うと同時に、ライフサイエンス分野のデータ統合にまつわる問題をともに考え、議論を深めるために、NBDCでは毎年10月5日を「トーゴーの日」としてシンポジウムを開催しています。
 2016年度は、生命科学系コンテンツに関するプログラム(統合化推進プログラム)から9件、データベース統合のための基盤技術開発から2件の成果報告を行うとともに、データベース統合とその利活用について、各分野の先生方にご講演いただく予定です。さらにデータベース利用者の方々による活用事例のご紹介や、国内のデータベース関係者によるポスター発表などを通じて、ライフサイエンスにおけるデータベースの開発・運用・利活用について広く議論する場として「トーゴーの日シンポジウム2016 ~統合データベース、実りの時へ~」を2日間にわたり開催いたします。

たくさんの皆さまのご参加をお待ちしています。

  • 日時:2016年10月5日(水)13:00~17:40
    10月6日(木)10:00~17:00
  • 会場:東京大学弥生講堂 一条ホール(東京都文京区)
  • 参加費:無料
  • 応募方法:シンポジウムサイトの参加登録よりお申し込みください。
    (申込締切:9月25日(日)まで)
  • 問い合わせ先:シンポジウム事務局(sympo2016[AT]biosciencedbc.jp)
    ([AT]を @ にかえて下さい)

 

統合データベース講習会:AJACS東女医大(2016年9月12日)の参加申し込みを開始しました。

AJACS東女医大ポスター統合データベース講習会:AJACSは、生命科学分野のデータベースやツールの使い方、データベースを統合する活動を紹介する初心者向けの講習会です。生命科学分野のデータベースを利用したい、研究に役立てたい方はどなたでもご参加いただけます。たくさんの皆さまのご参加をお待ちしています。

  • 日時:2016年9月12日(月)10:30~17:10
  • 会場:東京女子医科大学TWIns 2階会議室
    (東京都新宿区河田町8-1)
  • 定員:約50名
  • 参加費:無料
  • 応募方法:募集ページの応募フォームよりお申し込みください。
    (申込締切:9月5日(月)12:00まで)
  • 問い合わせ先:統合データベース講習会事務局(AJACS[AT]biosciencedbc.jp)
    ([AT]を @ にかえて下さい)

【統合化推進プログラム】大浪チーム、石濱チームのサイトビジットを実施し、発表資料を公開しました。

 2016年7月6日から7日にかけて、統合化推進プログラムにおける研究開発課題「生命動態情報と細胞・発生画像情報の統合データベース」を実施する大浪チーム、「プロテオーム統合データベースの構築」を実施する石濱チームへのサイトビジットを実施し、実施状況や今後の研究開発計画等について研究総括、研究アドバイザーらと意見交換しました。
 発表資料は、研究開発ページに掲載しています。

大浪チーム
 
日時:
2016年7月6日
場所:
理化学研究所 生命システム研究センター
 

 

石濱チーム
 
日時:
2016年7月7日
場所:
京都大学 薬学部本館
 

 

【NBDCヒトデータベース】九州大学病院 別府病院 外科 からの制限公開データ(Type I )を公開しました(hum0066)

研究題目:癌の再発・転移に関与するnon-coding RNAの同定とその機序の解明
からの制限公開データを公開しました。 研究内容はこちら

当該データの利用には、データ利用申請が必要です。申請の際には、NBDCヒトデータ共有ガイドラインおよびNBDCヒトデータ取扱いセキュリティガイドラインを熟読してください。

【NBDCヒトデータベース】大阪大学大学院 歯学研究科 からの制限公開データ(Type I )を公開しました(hum0027)

研究題目:侵襲性歯周炎のヒト全ゲノム解析と遺伝子多型解析
からの制限公開データを公開しました。研究内容はこちら

当該データの利用には、データ利用申請が必要です。申請の際には、NBDCヒトデータ共有ガイドラインおよびNBDCヒトデータ取扱いセキュリティガイドラインを熟読してください。