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【生命科学系データベースアーカイブ】「NBDC NikkajiRDF」 (国立研究開発法人 科学技術振興機構)のデータを更新しました。

「NBDC NikkajiRDF」は日本化学物質辞書(日化辞)のデータを化合物情報のRDF記述で標準となっているオントロジーを用いてRDF化したデータベースです。

今回の更新では、以下の1つのデータを新たに追加しました。

また、「日化辞の本体のRDFデータ」と 「日化辞のInChIのRDFデータ」 および 「日化辞のSMILESのRDFデータ」について、データを更新しました。

NBDC NikkajiRDF アーカイブ

生命科学系データベースアーカイブ

【NBDCヒトデータベース】熊本大学 国際先端医学機構 からの非制限公開データを公開しました(hum0044)

研究題目:ヒトレトロウイルス感染症に関する研究
からの非制限公開データを公開しました。 研究内容はこちら

当該データの利用の際には、NBDCヒトデータ共有ガイドラインおよびNBDCヒトデータ取扱いセキュリティガイドラインを熟読してください。

【NBDCヒトデータベース】理化学研究所 予防医療・診断技術開発プログラム からの制限公開データ(Type I )を公開しました(hum0083)

研究題目:バイオマーカー探索に資する網羅的遺伝子解析研究
からの制限公開データを公開しました。研究内容はこちら

当該データの利用には、データ利用申請が必要です。申請の際には、NBDCヒトデータ共有ガイドラインおよびNBDCヒトデータ取扱いセキュリティガイドラインを熟読してください。

【生命科学系データベースアーカイブ】「NITE NBRC Yeast Image Collection」(製品評価技術基盤機構)を追加しました。

「NITE NBRC Yeast Image Collection」 は、酵母の3種の形状(細胞、菌糸、胞子)画像と、撮影時の培地条件に関するデータを収録したデータベースです。

NITE NBRC Yeast Image Collection アーカイブ

生命科学系データベースアーカイブ

【生命科学系データベースアーカイブ】「Autophagy Database」(国立遺伝学研究所)を追加しました。

「Autophagy Database」は、多数の生物種におけるオートファジー関連タンパク質とそのホモログの情報を提供するデータベースです。

Autophagy Database アーカイブ

生命科学系データベースアーカイブ

【生命科学系データベースアーカイブ】「LEGENDA」を追加しました。

「LEGENDA」は、文献から抽出した疾患-遺伝子-物質との関係を納めた疾患情報テキストマイニングデータベースです。

LEGENDA アーカイブ

生命科学系データベースアーカイブ

【NBDCヒトデータベース】九州大学 生体防御医学研究所 トランスクリプトミクス分野 からの非制限公開データを公開しました(hum0016)

研究題目:精巣に発現するタンパク質群のヒト精子細胞における発現及び染色体局在解析
からの非制限公開データを公開しました。 研究内容はこちら

当該データの利用の際には、NBDCヒトデータ共有ガイドラインおよびNBDCヒトデータ取扱いセキュリティガイドラインを熟読してください。

【NBDCヒトデータベース】東京慈恵会医科大学 臨床検査医学講座 からの制限公開データ(Type I )を公開しました(hum0050)

研究題目:B型肝炎創薬へ向けてのトランスクリプトーム解析による病態解明と標的同定
からの制限公開データを公開しました。研究内容はこちら

当該データの利用には、データ利用申請が必要です。申請の際には、NBDCヒトデータ共有ガイドラインおよびNBDCヒトデータ取扱いセキュリティガイドラインを熟読してください。

第1回RDF講習会(2016年10月7日)を開催します。

トーゴーの日シンポジウム(10月5日・6日:NBDC主催)にあわせて、生命科学分野のRDFデータに関する講習会を開催します。NBDC、DBCLSにおけるRDFへの取り組みの紹介をはじめ、RDFやその関連技術に関する基礎から、SPARQLによるクエリの書き方まで、特に、既存のRDFデータに焦点をあてて解説します。
RDF(Resource Description Framework):ウェブ上の情報を機械可読にするための記述方法の一つ

  • 日時:2016年10月7日(金)10:00~16:00
  • 会場:JST東京本部別館2階会議室A-2(東京都千代田区五番町7)
  • 参加費:無料
  • 申込み方法:トーゴーの日シンポジウムウェブサイトの参加登録ページからの申込みとなります。
  • 主催:情報・システム研究機構ライフサイエンス統合データベースセンター(DBCLS)
    共催:科学技術振興機構(JST)バイオサイエンスデータベースセンター(NBDC)
  • 問い合わせ先:NBDCシンポジウム事務局(sympo2016[AT]biosciencedbc.jp)([AT]を @ にかえて下さい)

詳細は RDF講習会ウェブサイトをご覧下さい。

【生命科学系データベースアーカイブ】「ConfC」 (明治薬科大学 野口保教授)を追加しました。

「ConfC」は、PDB内のタンパク質立体構造から動的情報を抽出したデータベースです。

ConfC アーカイブ

生命科学系データベースアーカイブ