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日本人類遺伝学会第63回大会で開催したセミナー「『NBDCヒトデータベース』と『TogoVar』:人類遺伝学研究への貢献を目指して」の資料を公開しました。

日本人類遺伝学会第63回大会において、スポンサードセミナーとして開催したシンポジウム「『NBDCヒトデータベース』と『TogoVar』:人類遺伝学研究への貢献を目指して」(2018年10月11日)の講演動画および発表スライドを公開しました。

詳細はイベントのページからご覧ください。

【統合化推進プログラム】公共ChIP-seq データ全10万件を可視化し解析するデータベース「ChIP-Atlas」の論文が公開されました。

2018年11月9日、九州大学の沖真弥助教らのグループは、統合化推進プログラムにおける研究開発課題「エピゲノミクス統合データベースの開発と機能拡充」の一環として開発・運用している「ChIP-Atlas」についての論文を、EMBO Reportsで発表しました。
本論文では、ChIP-Atlasの利用方法や解析手法を述べるとともに、ChIP-Atlasの収録データの利用例を示しています。
概要は、論文発表に合わせて行ったプレスリリースをご覧ください。

〇論文情報
ChIP-Atlas: a data-mining suite powered by full integration of public ChIP-seq data
Shinya Oki, Tazro Ohta, Go Shioi, Hideki Hatanaka, Osamu Ogasawara, Yoshihiro Okuda, Hideya Kawaji, Ryo Nakaki, Jun Sese, and Chikara Meno EMBO Reports, 2018, e46255.(doi: 10.15252/embr.201846255)

〇プレスリリース
遺伝子のスイッチ役を「見える化」-バイオビッグデータを有効活用-(2018年11月9日付)

〇データベース情報
名称:ChIP-Atlas
概要   オリジナルサイト

〇研究開発課題の概要
「エピゲノミクス統合データベースの開発と機能拡充」
研究代表者 沖 真弥(九州大学 大学院医学研究院・助教)
研究期間 2017~2022年
概要・報告書等

第41回日本分子生物学会年会(2018年11月28日-30日)でブース展示とワークショップを開催します

NBDCは第41回日本分子生物学会年会において、ブース展示とワークショップを開催します。

ブースでは、様々なデータベースの開発者・運営者13チームが集まり、それぞれのサービスについてご説明します。どのようなデータベースがあるか、ご自身の研究のためにはどう使ったらいいかなど、お気軽にお尋ねください。

また、ワークショップでは、「統合化推進プログラム」に参加してデータベースの開発を行ってきた研究者8名が、それぞれのサービスについて詳しくご紹介します。 多くの皆さまのご来場をお待ちしております。

第41回日本分子生物学会年会

特別企画「使ってみようバイオデータベース -つながるデータ、広がる世界」(ブース展示)

ワークショップ「生命科学のデータベース活用法2018」

統合データベース講習会:AJACS名古屋2(2018年12月5日)の受講申し込みを開始しました。

AJACS名古屋2ポスター統合データベース講習会:AJACSは、生命科学分野のデータベースやツールの使い方、データベースを統合する活動を紹介する初心者向けの講習会です。生命科学分野のデータベースを利用したい、研究に役立てたい方はどなたでもご参加いただけます。たくさんの皆さまのご参加をお待ちしています。

  • 日時:2018年12月5日(水)10:00-15:40
  • 会場:愛知県がんセンター 国際医学交流センター 大会議室
    (愛知県名古屋市千種区鹿子殿1番1号)
  • 定員:約100名
  • 参加費:無料
  • 応募方法:募集ページの応募フォームよりお申し込みください。
    (申込締切:11月27日(火)12:00)
  • 問い合わせ先:統合データベース講習会事務局(AJACS[AT]biosciencedbc.jp)
    ([AT]を @ にかえて下さい)

【NBDCヒトデータベース】大阪大学免疫学フロンティア研究センター 実験免疫学 からの制限公開データ(Type I)を公開しました(hum0125)

研究題目:制御性T細胞特異的エピゲノム誘導による免疫制御の研究
からの制限公開データを公開しました。 研究内容はこちら

当該データの利用には、データ利用申請が必要です。申請の際には、NBDCヒトデータ共有ガイドラインおよびNBDCヒトデータ取扱いセキュリティガイドラインを熟読してください。

【NBDCブログ】新着記事「第21回画像の認識・理解シンポジウム(MIRU2018)参加報告」を掲載しました。

NBDCブログに新着記事「第21回画像の認識・理解シンポジウム(MIRU2018)参加報告」を掲載しました。

画像認識・理解技術に関する国内最大規模の会合であるMIRU2018(8/5~8、札幌)に参加したNBDC研究員が、ライフサイエンスへの応用研究を中心とした一般発表と特別企画について、平易な表現で簡潔に報告した記事です。

専門家ではないけれども、画像処理分野における深層学習(ディープラーニング)等の研究動向に興味があるという方は、ぜひご覧ください。

【NBDCヒトデータベース】福井大学医学部 耳鼻咽喉科・頭頸部外科学 からの制限公開データ(Type I)を公開しました(hum0128)

研究題目:慢性好酸球性炎症疾患の網羅的遺伝子解析と網羅的蛋白質解析に関する研究
からの制限公開データを公開しました。 研究内容はこちら

当該データの利用には、データ利用申請が必要です。申請の際には、NBDCヒトデータ共有ガイドラインおよびNBDCヒトデータ取扱いセキュリティガイドラインを熟読してください。

【メンテナンス】2018年 11月16日(金) の20:00 ~ 2018年 11月18日(日) 18:00の間、DBCLSにリンクしているサービスが停止します。

2018年 11月16日(金) の20:00 ~ 2018年 11月18日(日) 18:00の間、システムメンテナンスのため、トップページからDBCLSにリンクしている以下のサービスが一時的にご利用いただけなくなります。ご不便をおかけしますが、よろしくお願いいたします。

DBCLSサービス停止のお知らせ

http://dbcls.rois.ac.jp/ja/2018/10/26/post1.html

トップページからDBCLSにリンクしているサービス

【NBDCヒトデータベース】理化学研究所 生命医科学研究センター からの制限公開データ(Type I)を公開しました(hum0158)

研究題目:シークエンス解析によるがんゲノム研究:肝臓がん
からの制限公開データを公開しました。 研究内容はこちら

当該データの利用には、データ利用申請が必要です。申請の際には、NBDCヒトデータ共有ガイドラインおよびNBDCヒトデータ取扱いセキュリティガイドラインを熟読してください。

NBDCセンター長のインタビュー記事が日本経済新聞 電子版に掲載されました。

高木利久NBDCセンター長のインタビュー記事が、10月19日付の日本経済新聞 電子版に掲載されました。

詳しくは、日本経済新聞 電子版をご覧ください。