研究題目：腫瘍細胞におけるTGF-βファミリーシグナルの網羅的解析
からの制限公開データを公開しました。 研究内容はこちら。
当該データの利用には、データ利用申請が必要です。申請の際には、NBDCヒトデータ共有ガイドラインおよびNBDCヒトデータ取扱いセキュリティガイドラインを熟読してください。
2019年 2月22日(金) の18:00 ～ 2019年 2月24日(日) 18:00の間、システムメンテナンスのため、トップページからDBCLSにリンクしている以下のサービスが一時的にご利用いただけなくなります。ご不便をおかけしますが、よろしくお願いいたします。
https://dbcls.rois.ac.jp/ja/2019/02/07/post1.html
| DB名 | 概要 |
|---|---|
| Allie | MEDLINE を対象とし、出現する略字とその正規系のペアを検索するシステムです。略字を入力することで、それの使われ方を一覧表示します。 |
| BodyParts3D | BodyParts3D(ボディパーツ3D)は人体各部位の位置や形状を3次元モデルで記述したデータベースです。Anatomography(アナトモグラフィー)を使って、BodyParts3D から解剖学用語を選択して自由に人体のモデル図を作成できます。 |
| DBCLS galaxy | 生命科学データに特化したウェブベースの対話的ツール組み合わせインタフェースです。DBCLSで開発されたツール群も組み込んでいます。 |
| inMeXes | MEDLINE を対象とし、利用者が入力した文字列とマッチする表現を逐次的(１文字入力毎)に検索するシステムです。論文中の英語表現を容易に検索できます。 |
| RefEx（Reference Expression dataset） | EST、GeneChip、CAGE、RNA-seq の4 種類の異なる手法 によって得られたヒトおよびマウス、ラットにおける遺伝子発現データを並列に表示し、遺伝子発現解析を行う上で基準となるリファレンス（参照）データベースとして利用することを目的とした遺伝子発現データベースです。 |
| DBCLS SRA | 公共データベース（SRA [NCBI]、ENA [EBI]）、DRA[DDBJ] ）に登録された「次世代シーケンサ」データについて、目的別、機器別、生物種別等、さまざまな統計情報から閲覧、比較、データのダウンロードができる目次サイトです。論文からのデータの検索も可能です。 |
| TogoDB | エクセルなどのデータを簡単に読み込み、DB 化し、自動的に共通のウェブ検索インタフェースを生成するシステムです。 |
| TogoDoc | 文献情報及び論文PDF を管理し、また、特定の文献情報群に関連する論文情報を提示するシステムです。TogoDoc Client と連携して文献を管理することも可能なほか、スマートフォンにも対応しています。 |
| TogoWS | 国内各ウェブサービスの稼働状況を継続的に監視し、サービスの連携に必要なデータ形式変換機能等を提供するウェブサービスを統合するシステムです。 |
| ライフサイエンス 領域融合レビュー | 生命科学において注目される分野・学問領域に関する、第一線の研究者の執筆による日本語レビューを公開するサービスです。 |
| 統合TV | 生命科学分野の有用なデータベースやウェブツールの活用法を動画で紹介するウェブサイトです。 |
| 統合遺伝子検索GGRNA | 遺伝子や転写産物をさまざまなキーワードから素早く検索し、その結果をわかりやすく提示することができる遺伝子検索エンジンです。遺伝子名や各種ID、タンパクの機能や特徴などのキーワードだけでなく、短い塩基配列やアミノ酸配列から遺伝子を高速に検索することも可能です。 |
サーバーメンテナンスのため、平成31年2月15日(金)13:00～2月18(月)12:00までの間
『RDFポータルサイト』『HOWDY-R』『TogoVar』を停止いたします。ご不便をおかけしますが、よろしくお願いいたします。
(予備も含め、通信停止時間を長めに想定しております)
また予告なく停止の日程・時刻が変更になる可能性もございますのでご理解ご協力のほど宜しくお願いします。
＜停止サービス＞
・RDFポータルサイト（http://integbio.jp/rdf/）
・HOWDY-Rサイト（http://howdy.biosciencedbc.jp/HOWDY-R/）
・TogoVarサイト（https://togovar.biosciencedbc.jp/）
バイオサイエンスデータベースセンター（NBDC）では、現在、2019年度中に「統合データベース講習会：AJACS」を開催してくださる機関を募集しています。
応募締切：2019年3月11日（月）12:00（正午）
詳細は2019年度募集トップページをご覧ください。
研究題目：NASHの発症、進展を規定するメカニズム解析
からの制限公開データを公開しました。 研究内容はこちら。
当該データの利用には、データ利用申請が必要です。申請の際には、NBDCヒトデータ共有ガイドラインおよびNBDCヒトデータ取扱いセキュリティガイドラインを熟読してください。
NBDCブログに新着記事「セマンティック・ウェブ技術関係の研究会議に参加して ～JIST2018＆第46回SWO研究会参加報告～」を掲載しました。
2018年11月に淡路島で開催されたセマンティック・ウェブ技術関係の研究会議2件について、参加したNBDC研究員が、概要および自身が行った研究発表について紹介した記事です。
セマンティック・ウェブ技術を用いた知識発見等に興味をお持ちの方は、ぜひご覧ください。
バイオサイエンスデータベースセンター（NBDC）は、2018年12月9日から15日にかけて、情報・システム研究機構ライフサイエンス統合データベースセンター（DBCLS）とともに「国際開発者会議BioHackathon（バイオハッカソン）2018」を開催しました。
「ChemTHEATRE」は、環境中の化学物質のモニタリング結果を集めたデータベースです。
２型糖尿病36,614症例および対照者155,150名のゲノムワイド関連解析メタ解析データ（hum0014.v13.T2DMmeta.v1）をhum0014（研究題目：オーダーメイド医療の実現プログラム）に追加しました。研究内容はこちら。
当該データの利用の際には、NBDCヒトデータ共有ガイドラインおよびNBDCヒトデータ取扱いセキュリティガイドラインを熟読してください。
2月16日と17日、「第1回希少疾患インフォマティクス：情報保護・情報共有・社会実装」研究集会が、NBDCの協力のもと開催されます。
情報保護・情報共有・社会実装の観点から、ゲノム医療の可能性についてさまざまな立場から議論し、希少・難治性疾患のゲノム医療実現にむけてとりくむべき課題の明確化をめざします。
現在、参加登録受付中です。皆さまのご参加をお待ちしております。
協力：国立研究開発法人 科学技術振興機構 バイオサイエンスデータベースセンター
