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統合データベース講習会:AJACS尾張(2017年1月31日~2月1日)の受講申し込みを開始しました。

AJACS尾張ポスター統合データベース講習会:AJACSは、生命科学分野のデータベースやツールの使い方、データベースを統合する活動を紹介する初心者向けの講習会です。生命科学分野のデータベースを利用したい、研究に役立てたい方はどなたでもご参加いただけます。たくさんの皆さまのご参加をお待ちしています。

  • 日時:2017年1月31日(火)13:30-16:45
    2月1日(水)9:30-16:40
  • 会場:藤田保健衛生大学 生涯教育研修センター1号館 12階 IT学習室
    (愛知県豊明市沓掛町田楽ヶ窪1-98)
  • 定員:約50名
  • 参加費:無料
  • 応募方法:募集ページの応募フォームよりお申し込みください。
    (申込締切:1月19日(木)12:00まで)
  • 問い合わせ先:統合データベース講習会事務局(AJACS[AT]biosciencedbc.jp)
    ([AT]を @ にかえて下さい)

トーゴーの日シンポジウム2016のポスター発表データを公開しました。

「トーゴーの日シンポジウム2016 ~統合データベース、実りの時へ~」(2016年10月5日・10月6日)のポスター発表データを公開しました。

ポスター発表(10月5日・10月6日)

平成29年1月12, 23, 24, 25, 26及び27日(各日09:00 - 18:00)、『biosciencedbc.jp』と『integbio.jp』ドメインに関連した一部サービスが停止します。

サーバーメンテナンスのため、『biosciencedbc.jp』と『integbio.jp』ドメインに関連した一部サービスが停止します。ご不便をおかけしますが、よろしくお願いいたします。

平成 28 年 12 月 20 日(火) に続き2回目の停止をいたします。2回目は各サービスごとに停止する日が異なります。日程は以下の通りです
作業の状況により、予定の時間を前後する可能性もございますが、各サービスの停止時間は09:00 - 18:00を予定しております。 (予備も含め、通信停止時間を長めに想定しております)
また予告なく停止の日程・時刻が変更になる可能性もございますのでご理解ご協力のほど宜しくお願いします。

①1/12(木) 停止サービス
・NBDCポータルサイト(http://biosciencedbc.jp
・広報サイト(http://events.biosciencedbc.jp
・TogoProt Webインタフェース(http://biosciencedbc.jp/togoprot/

②1/23(月) 停止サービス
・ヒトゲノムバリエーション(GWAS-DB)(https://gwas.biosciencedbc.jp/
・生命科学データベース横断検索システム(http://biosciencedbc.jp/dbsearch/
・生命科学系データベースアーカイブ FTPサイト
・生命科学系データベースアーカイブ 簡易検索(TogoDB)
 
③1/24(火) 停止サービス
・文科省:ライフサイエンス広場(http://www.lifescience.mext.go.jp/
・NBDCヒトデータベース(http://humandbs.biosciencedbc.jp/
・実務者連絡会(https://wg.biosciencedbc.jp/doku.php
・PURL(http://purl.jp/
・文科省:統合データベース整備事業(http://lifesciencedb.mext.go.jp/
・横断検索 Webインターフェース(http://biosciencedbc.jp/dbsearch/
・Integbioデータベースカタログ(http://integbio.jp/dbcatalog/?lang=ja
・生命科学系データベースアーカイブ メインサイト(http://dbarchive.biosciencedbc.jp/index.html
・生命科学系データベースアーカイブ 簡易検索(TogoDB)
・生命科学系データベースアーカイブ 相同性検索(http://dbarchive.biosciencedbc.jp/blast/
・生命科学系データベースアーカイブ SPARQL Endpoint(https://dba-rdf.biosciencedbc.jp/sparql

④1/25(水) 停止サービス
・生命科学系データベースアーカイブ FTPサイト
・生命科学系データベースアーカイブ 簡易検索(TogoDB)

⑤1/26(木) 停止サービス
・HOWDY-R(http://howdy.biosciencedbc.jp/HOWDY-R/
・integbio.jpポータルサイト(http://integbio.jp/ja/
・生命科学系データベースアーカイブ 画像検索(http://dbarchive.biosciencedbc.jp/image_search/

⑥1/27(金) 停止サービス
・生命科学系データベースアーカイブ 簡易検索(TogoDB)(一部データの参照不可)

平成 28 年 12 月 20 日(火) 10:00 - 17:00 の間 『biosciencedbc.jp』と『integbio.jp』ドメインに関連した全サービスが停止します

平成 28 年 12 月 20 日(火) 10:00 - 17:00 の間 、サーバーメンテナンスのため、『biosciencedbc.jp』と『integbio.jp』ならびに『purl.jp』ドメインに関連したサービスが停止します。ご不便をおかけしますが、よろしくお願いいたします。

2回に分けて停止いたします。2回目は各サービスごとに停止する日が異なります。日程はこちらになります。
作業の状況により、予定の時間を前後する可能性もございますが、各サービスの停止時間は09:00 - 18:00を予定しております。 (予備も含め、通信停止時間を長めに想定しております)

また予告なく停止の日程が変更になる可能性もございますのでご理解ご協力のほど宜しくお願いします。

なお、メンテナンス中も下記サイトは利用可能です。

NBDCポータルサイト(http://biosciencedbc.jp/)
NBDC RDFポータル(http://integbio.jp/rdf/)
ご理解ご協力のほど宜しくお願いします。

【NBDCヒトデータベース】 国立がん研究センター研究所 分子病理分野 からの制限公開データ(Type I )を公開しました(hum0090)

国際ヒトエピゲノムコンソーシアム (IHEC)に参画する我が国の代表研究チームより、日本人検体より得られた高度に純化した正常ヒト大腸吸収上皮細胞のエピゲノムデータが初めて公開されました(研究題目: ヒト消化器ならびに泌尿器上皮細胞の標準エピゲノム解析)。研究内容はこちら

当該データの利用には、データ利用申請が必要です。申請の際には、NBDCヒトデータ共有ガイドラインおよびNBDCヒトデータ取扱いセキュリティガイドラインを熟読してください。

第39回日本分子生物学会年会(2016年11月30日(水)~12月2日(金)@パシフィコ横浜)の特別企画に出展します。

特別企画「使ってみようデータベース -つながるデータ、広がる世界」

ゲノム、蛋白質、糖鎖、代謝物、化合物などのデータの種類やヒト、マウス、植物、微生物などの生物種ごとにまとめたデータベースをポスター、配布資料やPCを用いたデモなどにより紹介します。どのようなデータベースがあるのか、ぜひお尋ねください。また、これらの多様な生命科学のコンテンツを探す、抽出する、整理する、つなげる、解析する情報技術の開発やバイオデータベースを整備して使いやすくする取組(データベースの統合化)についても紹介します。

  • 企画:国立研究開発法人科学技術振興機構 バイオサイエンスデータベースセンター
  • 日時:2016年11月30日(水)~12月2日(金) 10:00~18:00
  • 会場:パシフィコ横浜 展示ホールA・B・C バイオデータベースコーナー

詳しくは、こちらをご覧ください。

【生命科学系データベースアーカイブ】「NBDC NikkajiRDF」 (国立研究開発法人 科学技術振興機構)のデータを更新しました。

「NBDC NikkajiRDF」は日本化学物質辞書(日化辞)のデータを化合物情報のRDF記述で標準となっているオントロジーを用いてRDF化したデータベースです。

今回の更新では、以下の1つのデータを新たに追加しました。

また、「日化辞の本体のRDFデータ」と 「日化辞のInChIのRDFデータ」 および 「日化辞のSMILESのRDFデータ」について、データを更新しました。

NBDC NikkajiRDF アーカイブ

生命科学系データベースアーカイブ

【NBDCヒトデータベース】熊本大学 国際先端医学機構 からの非制限公開データを公開しました(hum0044)

研究題目:ヒトレトロウイルス感染症に関する研究
からの非制限公開データを公開しました。 研究内容はこちら

当該データの利用の際には、NBDCヒトデータ共有ガイドラインおよびNBDCヒトデータ取扱いセキュリティガイドラインを熟読してください。

【NBDCヒトデータベース】理化学研究所 予防医療・診断技術開発プログラム からの制限公開データ(Type I )を公開しました(hum0083)

研究題目:バイオマーカー探索に資する網羅的遺伝子解析研究
からの制限公開データを公開しました。研究内容はこちら

当該データの利用には、データ利用申請が必要です。申請の際には、NBDCヒトデータ共有ガイドラインおよびNBDCヒトデータ取扱いセキュリティガイドラインを熟読してください。

【生命科学系データベースアーカイブ】「NITE NBRC Yeast Image Collection」(製品評価技術基盤機構)を追加しました。

「NITE NBRC Yeast Image Collection」 は、酵母の3種の形状(細胞、菌糸、胞子)画像と、撮影時の培地条件に関するデータを収録したデータベースです。

NITE NBRC Yeast Image Collection アーカイブ

生命科学系データベースアーカイブ