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【NBDCヒトデータベース】 国立がん研究センター研究所 分子病理分野 からの制限公開データ(Type I )を公開しました(hum0090)

国際ヒトエピゲノムコンソーシアム (IHEC)に参画する我が国の代表研究チームより、日本人検体より得られた高度に純化した正常ヒト大腸吸収上皮細胞のエピゲノムデータが初めて公開されました(研究題目: ヒト消化器ならびに泌尿器上皮細胞の標準エピゲノム解析)。研究内容はこちら

当該データの利用には、データ利用申請が必要です。申請の際には、NBDCヒトデータ共有ガイドラインおよびNBDCヒトデータ取扱いセキュリティガイドラインを熟読してください。

第39回日本分子生物学会年会(2016年11月30日(水)~12月2日(金)@パシフィコ横浜)の特別企画に出展します。

特別企画「使ってみようデータベース -つながるデータ、広がる世界」

ゲノム、蛋白質、糖鎖、代謝物、化合物などのデータの種類やヒト、マウス、植物、微生物などの生物種ごとにまとめたデータベースをポスター、配布資料やPCを用いたデモなどにより紹介します。どのようなデータベースがあるのか、ぜひお尋ねください。また、これらの多様な生命科学のコンテンツを探す、抽出する、整理する、つなげる、解析する情報技術の開発やバイオデータベースを整備して使いやすくする取組(データベースの統合化)についても紹介します。

  • 企画:国立研究開発法人科学技術振興機構 バイオサイエンスデータベースセンター
  • 日時:2016年11月30日(水)~12月2日(金) 10:00~18:00
  • 会場:パシフィコ横浜 展示ホールA・B・C バイオデータベースコーナー

詳しくは、こちらをご覧ください。

【生命科学系データベースアーカイブ】「NBDC NikkajiRDF」 (国立研究開発法人 科学技術振興機構)のデータを更新しました。

「NBDC NikkajiRDF」は日本化学物質辞書(日化辞)のデータを化合物情報のRDF記述で標準となっているオントロジーを用いてRDF化したデータベースです。

今回の更新では、以下の1つのデータを新たに追加しました。

また、「日化辞の本体のRDFデータ」と 「日化辞のInChIのRDFデータ」 および 「日化辞のSMILESのRDFデータ」について、データを更新しました。

NBDC NikkajiRDF アーカイブ

生命科学系データベースアーカイブ

【NBDCヒトデータベース】熊本大学 国際先端医学機構 からの非制限公開データを公開しました(hum0044)

研究題目:ヒトレトロウイルス感染症に関する研究
からの非制限公開データを公開しました。 研究内容はこちら

当該データの利用の際には、NBDCヒトデータ共有ガイドラインおよびNBDCヒトデータ取扱いセキュリティガイドラインを熟読してください。

【NBDCヒトデータベース】理化学研究所 予防医療・診断技術開発プログラム からの制限公開データ(Type I )を公開しました(hum0083)

研究題目:バイオマーカー探索に資する網羅的遺伝子解析研究
からの制限公開データを公開しました。研究内容はこちら

当該データの利用には、データ利用申請が必要です。申請の際には、NBDCヒトデータ共有ガイドラインおよびNBDCヒトデータ取扱いセキュリティガイドラインを熟読してください。

【生命科学系データベースアーカイブ】「NITE NBRC Yeast Image Collection」(製品評価技術基盤機構)を追加しました。

「NITE NBRC Yeast Image Collection」 は、酵母の3種の形状(細胞、菌糸、胞子)画像と、撮影時の培地条件に関するデータを収録したデータベースです。

NITE NBRC Yeast Image Collection アーカイブ

生命科学系データベースアーカイブ

【生命科学系データベースアーカイブ】「Autophagy Database」(国立遺伝学研究所)を追加しました。

「Autophagy Database」は、多数の生物種におけるオートファジー関連タンパク質とそのホモログの情報を提供するデータベースです。

Autophagy Database アーカイブ

生命科学系データベースアーカイブ

【生命科学系データベースアーカイブ】「LEGENDA」を追加しました。

「LEGENDA」は、文献から抽出した疾患-遺伝子-物質との関係を納めた疾患情報テキストマイニングデータベースです。

LEGENDA アーカイブ

生命科学系データベースアーカイブ

【NBDCヒトデータベース】九州大学 生体防御医学研究所 トランスクリプトミクス分野 からの非制限公開データを公開しました(hum0016)

研究題目:精巣に発現するタンパク質群のヒト精子細胞における発現及び染色体局在解析
からの非制限公開データを公開しました。 研究内容はこちら

当該データの利用の際には、NBDCヒトデータ共有ガイドラインおよびNBDCヒトデータ取扱いセキュリティガイドラインを熟読してください。

【NBDCヒトデータベース】東京慈恵会医科大学 臨床検査医学講座 からの制限公開データ(Type I )を公開しました(hum0050)

研究題目:B型肝炎創薬へ向けてのトランスクリプトーム解析による病態解明と標的同定
からの制限公開データを公開しました。研究内容はこちら

当該データの利用には、データ利用申請が必要です。申請の際には、NBDCヒトデータ共有ガイドラインおよびNBDCヒトデータ取扱いセキュリティガイドラインを熟読してください。