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【Integbioデータベースカタログ】データベース情報の項目追加を行いました。

以下について項目追加・内容更新を行いました。

・「カテゴリ」の語彙の整理を行い「タグ」として更新しました。
「レコード詳細」ページにおいて「カテゴリ」としていたデータベースに説明を付与するための語彙について再検討を行い、「タグ」と改め内容を更新しました。
本カタログについて

・「類似データベース」情報を追加しました。
カタログに掲載した各データベース間の類似度推定を行った結果を、各データベースの「レコード詳細」ページに「類似データベース」として追加しました。
また、類似度を用いた全体関係マップを見られる「データベース関係マップ」のページを追加しました。現バージョンのマップは実験的なものであり、今後更新していきます。

BioSharingとの連携に関連した項目を追加しました。
国際的な生命科学系データベース情報を収集・公開しているBioSharingとデータベース情報の収集に関して連携を始めます。これに関連して「レコード詳細」ページに「BioSharingへのリンク」と「レコード作成機関」の項目を追加しました。

【生命科学系データベースアーカイブ】「PGDBj - オルソログデータベース」(大阪大学 中谷明弘特任教授)を更新しました。

「PGDBj - オルソログデータベース」は、異なる生物種間におけるアミノ酸配列の類似性に基づいた遺伝子のオルソログ情報を蓄積したデータベースです。

今回の更新では、以下の6つのデータを更新しました。

PGDBj - オルソログデータベース アーカイブ

生命科学系データベースアーカイブ

【NBDCヒトデータベース】大阪大学医学部附属病院 未来医療開発部 からの制限公開データ(Type I )を公開しました(hum0055)

研究題目:非アルコール性脂肪肝疾患のゲノム・エピゲノム解析
からの制限公開データを2017/02/20より公開しました。 研究内容はこちら

当該データの利用の際には、NBDCヒトデータ共有ガイドラインおよびNBDCヒトデータ取扱いセキュリティガイドラインを熟読してください。 制限公開データの利用には、データ利用申請が必要です。

【生命科学系データベースアーカイブ】「シロイヌナズナフェノームデータベース」(理化学研究所 桝屋啓志ユニットリーダー)を追加しました。

「シロイヌナズナフェノームデータベース」は、シロイヌナズナ変異体観察情報などから成るシロイヌナズナの表現型データベースです。

シロイヌナズナフェノームデータベース アーカイブ

生命科学系データベースアーカイブ

【NBDCヒトデータベース】 制限公開データ1件および非制限公開データ1件が追加されました(hum0005.v2)

非症候群性難聴44症例(JGAS00000000032:39症例、DRA003791:5症例)の69遺伝子領域(354 kb)のデータをhum0005(研究題目:難聴の遺伝子解析と臨床応用に関する研究)に追加しました。
研究内容はこちら

当該データの利用の際には、NBDCヒトデータ共有ガイドラインおよびNBDCヒトデータ取扱いセキュリティガイドラインを熟読してください。
制限公開データの利用には、データ利用申請が必要です。

【メンテナンス】2017年03月03日(金) の17:00~3月6日(月) 12:00の間、DBCLSにリンクしているサービスが停止します。

2017年03月03日(金) の17:00~3月6日(月) 12:00 の間、システムメンテナンスのため、トップページからDBCLSにリンクしている以下のサービスが一時的にご利用いただけなくなります。ご不便をおかけしますが、よろ しくお願いいたします。

DBCLSサービス停止のお知らせ

http://dbcls.rois.ac.jp/archives/3395

トップページからDBCLSにリンクしているサービス

【NBDCヒトデータベース】 大阪府立成人病センター からの制限公開データ(Type I )を公開しました(hum0061)

研究題目:全ゲノムあるいは全エクソン解析による家族性腫瘍原因遺伝子の同定
からの制限公開データを公開しました。 研究内容はこちら

当該データの利用には、データ利用申請が必要です。申請の際には、NBDCヒトデータ共有ガイドラインおよびNBDCヒトデータ取扱いセキュリティガイドラインを熟読してください。

【生命科学系データベースアーカイブ】「DB-SPIRE」(明治薬科大学 野口保教授)を追加しました。

「DB-SPIRE」は、アミノ酸配列モチーフのタンパク質立体構造における位置を登録したデータベースです。

DB-SPIRE アーカイブ

生命科学系データベースアーカイブ

【生命科学系データベースアーカイブ】「dbQSNP」 (九州大学 林健志名誉教授)を追加しました。

「dbQSNP」 は、ヒトゲノム上のSNPのアレル頻度を種々のプールDNAのSSCP解析により決定したデータベースです。

dbQSNP アーカイブ

生命科学系データベースアーカイブ

統合化推進プログラムの面接選考会日程を公開しました。

 統合化推進プログラムの平成29年度公募に係る面接選考会日程を決定し、公開しました。詳細は、公募情報ページをご覧ください。