NGS速習コース講習会2014
ライフサイエンス分野の研究現場においては、莫大・多様な研究データが産出され、取り扱うデータ量が飛躍的に増えています。一方で、それらのデータを整備・活用するための人材は不足している状況です。 このような研究現場の状況を踏まえ、NBDC運営委員会人材育成分科会において、研究データを整備・活用するバイオインフォマティクス人材を育成するためのカリキュラムが策定されました。 今回のカリキュラムは対応が急務であると思われる次世代シークエンサ(NGS)データに焦点を当てた内容となっており、最低限必要とされる知識・技術を2週間程度で身につけることを想定した「速習」と、時間をかけて習得することを想定した「速習以外」に分かれています。 このカリキュラムに基づき、下記日程で2週間にわたる「速習」コースを試行的に開催し、受講者とオブザーバー(TA)を募集します。
開催概要
日程
9月1日 | 10:40-12:00 | 1. コンピュータリテラシーとサーバー設計 1-1. OS、ハード構成 [初級] [講義] |
13:15-14:45 | 1. コンピュータリテラシーとサーバー設計 1-2. ネットワーク基礎 [初級] [講義] |
|
15:00-18:15 | 1. コンピュータリテラシーとサーバー設計 1-3. UNIX I [初級] [実習] |
|
9月2日 | 10:30-18:15 | 1. コンピュータリテラシーとサーバー設計 (続)1-3. UNIX I [中級] [実習] |
9月3日 | 10:30-18:15 | 1. コンピュータリテラシーとサーバー設計 1-4. スクリプト言語 [中級] [実習] |
9月4日 | 10:30-18:15 | 1. コンピュータリテラシーとサーバー設計 (続)1-4. スクリプト言語 [中級] [実習] |
9月5日 | 10:30-14:45 | 2. 配列インフォマティクス 2-1. 配列解析基礎 [初級] [実習] |
15:00-18:15 | 2. 配列インフォマティクス 2-2. バイオ系データベース概論 [初級] [実習] |
|
9月8日 | 10:30-12:00 | 3. データ解析基礎 3-1. R基礎1 [初級] [実習] |
13:15-14:45 | 3. データ解析基礎 3-2. R基礎2 [初級] [実習] |
|
15:00-18:15 | 3. データ解析基礎 3-3. R各種パッケージ [中級] [実習] |
|
9月9日 | 10:30-14:45 | 3. データ解析基礎 3-4. R bioconductor I [中級] [実習] |
15:00-18:15 | 3. データ解析基礎 3-5. R bioconductor II [中級] [実習] |
|
9月10日 | 10:30-12:00 | 4. 次世代シークエンサ 4-1. 次世代シークエンサ基礎I [初級] [講義] |
13:15-14:45 | 4. 次世代シークエンサ 4-2. 次世代シークエンサ基礎II [初級] [講義] |
|
15:00-18:15 | 4. 次世代シークエンサ 4-3. 次世代シークエンサ実習I [初級] [実習] |
|
9月11日 | 10:30-14:45 | 4. 次世代シークエンサ 4-4. 次世代シークエンサ実習II [初級] [実習] |
15:00-16:30 | 6. 分子生命科学 6-1. 分子生命科学概論 [初級] [講義] |
|
6. 分子生命科学 6-2. オミクス概論 [初級] [講義] |
||
6. 分子生命科学 6-3. 遺伝/進化概論 [初級] [講義] |
||
16:45-18:15 | 5. ゲノム関連の倫理・法律 5-1. ゲノム情報倫理概論 [初級] [講義] |
|
9月12日 | 10:30-16:30 | 4. 次世代シークエンサ 4-4. 次世代シークエンサ実習II [初級] [実習] |
講義動画
1-1. OS、ハード構成、1-2. ネットワーク基礎
中村 保一
1-3. UNIX I
仲里 猛留
1-4. スクリプト言語
服部 恵美
2-1. 配列解析基礎
坊農 秀雅
2-2. バイオ系データベース概論
坊農 秀雅
3-1. R基礎1、3-2. R基礎2、3-3. R各種パッケージ
門田 幸二
3-4. R bioconductor I、3-5. R bioconductor II
門田 幸二
4-1. 次世代シークエンサ基礎I
倉田 哲也
4-2. 次世代シークエンサ基礎II
倉田 哲也
4-3. 次世代シークエンサ実習I
山口 昌雄
4-4. 次世代シークエンサ実習II
河岡 慎平
6-1. 分子生命科学概論、6-2. オミクス概論、6-3. 遺伝/進化概論
河岡 慎平
5-1. ゲノム情報倫理概論
箕輪 真理、川嶋 実苗
4-4. 次世代シークエンサ実習II
山口 昌雄
講義資料
講義資料は以下のWebサイトをご覧ください。
下記Webサイトは、東京大学・門田 准教授が運営しています。当該ページの内容は、本ページでお知らせすることなく更新される事がありますのでご留意ください。