AJACS「MAG (Metagenome-Assembled Genome) を知って・学んで・使う」
- 参加受付中
「データ解析講習会：AJACS（あじゃっくす）」は、生命科学におけるデータ解析の入り口を提供します。
メタゲノム解析においては、メタゲノム配列から個々の細菌のゲノム配列を再構築する、MAG (Metagenome Assembled Genome) 技術が注目を集めています。AJACS「MAGを知って・学んで・使う」では、現状のMAG解析技術の利点と問題点、公共データの目的に応じた再利用方法を、国立遺伝学研究所 森 宙史氏にご紹介いただきます。
お知らせ
-
2024年6月5日プログラム詳細を公開し、受講登録の受付を開始しました。
受講登録
受講登録
締切：2024年7月18日 (木) 深夜24時
プログラム
| 13:30～13:40 | NBDCの紹介 |
|
13:40～14:40 |
メタゲノムとMAG解析について 森 宙史氏 (国立遺伝学研究所) 微生物群集の系統組成や遺伝子機能組成を解析する手法としてメタゲノム解析は広く用いられている。本講義ではメタゲノム解析の概要と最近の解析のトレンドである、メタゲノム配列から個々の細菌のゲノム配列（Metagenome Assembled Genome:MAG）を再構築するMAG解析技術について解説する。現状のMAG解析技術の利点と問題点を知ることでメタゲノムデータや論文を適切に解釈できるようになる。 |
|
14:50～15:50 |
メタゲノム・MAGデータを検索する 森 宙史氏 (国立遺伝学研究所) メタゲノム配列データおよびMAG配列データは公共の塩基配列レポジトリおよび様々なデータベース中に存在し自由に利用することが可能である。本講義ではINSDCのデータベースやMGnify、Microbiome Datahubなど、代表的なメタゲノムおよびMAGのデータベースにおけるデータの検索や利用方法について解説する。本講義を受けることで目的に応じて既存のメタゲノムデータやMAGデータを探索し再利用することが可能になる。 |
- 講義資料は開催日の前日までに公開します。
- 講義動画は後日公開予定です。
開催概要
| 日時 | 2024年7月25日 (木) 13:30-15:50 |
|---|---|
| 開催方法 |
YouTube Live によるライブ配信 (予定) |
| 参加費 | 無料 |
| 主催 | 国立研究開発法人科学技術振興機構（JST） |
| 共催 | 大学共同利用機関法人情報・システム研究機構 データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター（DBCLS） |
| 問合せ先 |
AJACS[AT]biosciencedbc.jp |
AJACS（あじゃっくす）とは
ライフサイエンス分野のデータベース統合を担う人材、アノテーター（Annotator）、キュレーター（Curator）、システムデータベース管理者（System DB administrator）の総称です（All Japan Annotator/Curator/System DB administrator）。AJACSな人は、統合データベースの作成・維持・管理にかかわる新たな職種です。
