統合的な転写制御データ基盤の構築

進行中
統合化推進プログラム (DICP)
2022年度採択（本格型）

粕川雄也

理化学研究所生命医科学研究センターチームディレクター

転写制御の総合的理解をサポートするため、シスエレメント・トランス因子・エピゲノミクスデータを統合したデータ基盤INTRAREDを構築する。INTRAREDは同一染色体上で遺伝子の発現の調節に関わるゲノム中の領域であるシスエレメントについて、その領域や細胞の種類・状態毎のシスエレメント領域の活性状態を同定して収録したシスエレメントデータベースfanta.bioと、シスエレメントに結合するトランス因子や関連するエピゲノミクス情報を提供するChIP-Atlasで構成され、相互連携したビューを提供する。