【横断検索】「生命科学データベース横断検索」から6件のDBが追加で検索できるようになりました。

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2018年2月23日

「生命科学データベース横断検索」から6件のDBが追加で検索できるようになりました。

  • 「Pt_spiderBASE」:モデル節足動物であるオオヒメグモ (Parasteatoda tepidariorum) のESTのデータベースです。ESTシーケンスの情報閲覧、BLAST検索ができます。他生物の配列に対するEST配列のBLASTX結果も閲覧でき、Clone IDやタンパク質名等で検索できます。
  • 「FAIRsharing.org」:生命科学、環境科学、バイオメディカル分野を中心としたデータ共有のためのレジストリサイトです。2017年7月に前身であるbiosharing.orgからFAIRsharing.orgへ変更され、カバー範囲をサイエンス一般に拡大しました。Standards, Databases, Policies, Collectionsの4種の情報をカタログ型に整理し、提供しています。Standardsはオントロジーなどを、Databasesはデータベースに関する情報を、Policiesはデータ共有やメタデータに関するポリシーを、Collectionsは関連する組織等の情報をまとめています。
  • 「NBDC RDF Portal」:生命科学分野のデータベースをRDF形式で一箇所に集約したポータルサイトです。JSTバイオサイエンスデータベースセンター (NBDC) と情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター (DBCLS)で共同開発しています。DBCLSによって策定された質の高いRDFデータ作成のためのガイドライン (http://wiki.lifesciencedb.jp/mw/RDFizingDatabaseGuideline) に準拠し、一定以上の質を保った信頼性の高いRDFを公開しています。 利用者は、NBDC RDF Portalに収められた様々な研究機関が作成したデータベースについて、データの説明を閲覧し、データのダウンロードやSPARQL (RDF形式データの標準問い合わせ言語) による検索を行うことができます。
  • 「GlyTouCan」:糖鎖構造データを収録した国際糖鎖構造リポジトリです。単糖類組成からグリコシド結合形状などの明確な構造まで、構造に不一致がない限り世界的にユニークなアクセッション番号を付けて登録することができます。キーワード、モチーフ、糖鎖構造画像からの検索、モチーフや糖鎖のリストからのブラウズが可能です。

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