細胞レベルの機能・表現型と遺伝子発現を関連付ける「Cell IO」データベースの開発

カテゴリ

  • 進行中
  • 統合化推進プログラム (DICP)
  • 2024年度採択(育成型)

研究代表者氏名・所属

尾崎 遼

筑波大学 医学医療系 准教授

研究開発の概要

細胞の機能・表現型を整理したデータベースCell IOを構築する。ヒトやマウスなどの1細胞トランスクリプトームデータと紐づく細胞の機能・表現型と摂動情報を整理する。文献から細胞の由来、機能・表現型、摂動の種類、生物種等の情報を抽出し、検索やデータ統合を容易にする。遺伝子発現を細胞の機能・表現型として解釈可能にするとともに、オミクスデータから細胞の機能・表現型を予測する研究や所望の機能・表現型を持つ細胞をデザインする研究などに貢献する。

主な研究開発対象データベース

Cell IO

研究開発期間

2024年4月~2027年3月

グラント番号

JPMJND2402

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