細胞レベルの機能・表現型と遺伝子発現を関連付ける「Cell IO」データベースの開発
カテゴリ
- 進行中
- 統合化推進プログラム (DICP)
- 2024年度採択(育成型)
研究代表者氏名・所属
尾崎 遼
筑波大学 医学医療系 准教授
研究開発の概要
細胞の機能・表現型を整理したデータベースCell IOを構築する。ヒトやマウスなどの1細胞トランスクリプトームデータと紐づく細胞の機能・表現型と摂動情報を整理する。文献から細胞の由来、機能・表現型、摂動の種類、生物種等の情報を抽出し、検索やデータ統合を容易にする。遺伝子発現を細胞の機能・表現型として解釈可能にするとともに、オミクスデータから細胞の機能・表現型を予測する研究や所望の機能・表現型を持つ細胞をデザインする研究などに貢献する。
主な研究開発対象データベース
Cell IO
研究開発期間
2024年4月~2027年3月
グラント番号
JPMJND2402