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国立研究開発法人 科学技術振興機構

研究開発の成果（サービス）

NBDCが直接開発・提供するウェブサービスをご紹介します。

なお、運営主体を変更したウェブサービスについての情報は以下のページをご参照ください。

Integbioデータベースカタログ

https://integbio.jp/dbcatalog/?lang=ja

Integbioデータベースカタログは、国内外の生命科学系データベースの情報を収集し、公開しています。
データベースの公開・更新・閉鎖情報は研究論文で発表されない場合があるため、文献を探索するだけでは研究分野の動向を網羅することはできません。本サービスでは、2,541件（2022年7月時点）を超えるデータベースの概要情報（URL、収録生物種、一括ダウンロードの可否やそのURLなど）を収録しており、俯瞰的・永続的に検索・閲覧できます。
なお、 2017年からは、英国FAIRsharing.orgと連携し、データベース情報を交換して網羅性の向上に努めています。

外部発表等

使い方の紹介動画

生命科学データベース横断検索

https://dbsearch.biosciencedbc.jp/?lang=ja

生命科学データベース横断検索は、多種多様なデータベースを横断的に検索できるサービスです。ある遺伝子名・生物種名が、国内特許や世界中のどのデータベースでどのように言及されているかを、ひとまとめにして知ることができます。本サービスの検索対象データベースは766件以上（2022年7月現在）で、順次追加しています。
本サービスは生命科学専門ではありますが、生命科学といえども包含される研究分野は多岐に渡ります。また、検索対象のデータベースは、それぞれ運営の主体や所在が異なります。このため、本サービスでは、横断的な検索を実現するために、各データベースの運用機関との間で、検索用の索引データの相互共有や検索仕様の共通化などを行っています。また、閲覧者の意図に沿った検索結果を提供するため、バックエンド（ページ・ランク・スコア算出方法の改善や検索ログに基づく調整など）、フロントエンド（検索キーワードの例示、検索履歴保存機能の追加など）両面での改良を続けています。

本サービスの検索データベース情報は、下記サービスと共同で管理・運用しています。

外部発表等

使い方の紹介動画

生命科学系データベース アーカイブ

https://dbarchive.biosciencedbc.jp/

生命科学系データベース アーカイブは、国内外の研究者が産生した様々なデータセットを、データ産生者本人からの寄託に基づいて公開しています。人類の共有財産である研究データを長期的・安定的に保管し、広く再利用できるかたちで公開し続けます。
データセットは一括でダウンロードできるほか、ブラウザ上で簡易的に閲覧・検索することも可能です。
本サービスでは、研究データの保管・共有・公開のモデルケースを示すべく、次のような取り組みを行っています。

  1. データセットに対する統一形式での説明（メタデータ）を掲載
  2. クリエイティブコモンズを利用し、分かり易い利用許諾条件を表示
  3. データセットの寄託に際してスタッフが研究データを精査し、寄託者と相談のうえ第三者が理解しやすいような形式・表現となるようキュレーション
  4. データセットごとにDOIを付与

外部発表等

使い方の紹介動画

関連情報

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