機械学習を用いたタンパク質－リガンド結合部位予測ツールの自動生成パイプラインの開発

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研究代表者氏名・所属

研究開発の概要

利用者が指定したリガンド（糖、脂質、金属イオンなど）に対し、そのリガンドが結合するタンパク質の部位（リガンド結合部位）を予測するツールの自動生成パイプラインを開発する。すでに開発したリガンド結合部位データベースにほかの最新データを統合することで、機械学習に基づく高精度な予測ツールを生成する。生成される予測ツールは立体構造未知なタンパク質も予測可能で計算コストも小さく、ゲノムワイドな予測が可能である。

主な研究開発対象データベース

• UTProt Galaxy
• PLBSPResidue
• UTProt CKAN
• Ligand Binding Residue Predictor Generator in UTProt Galaxy

研究開発期間

2013年9月～2014年1月

資料

発表資料

• 中間報告会(5.10MB)
• 終了報告会(4.66MB)

報告書

• 終了報告書(3.3MB)

評価

• 事後(0.1MB)