ポスター発表
【53】jPOSTリポジトリの機能強化
発表者
◯渡辺由（新潟大）、奥田修二郎（新潟大）、守屋勇樹（DBCLS）、河野信（DBCLS、富山国際大）、松本雅記（新潟大）、高見知代（新潟大）、小林大樹（新潟大）、幡野敦（新潟大）、山ノ内祥訓（熊本大）、荒木令江（熊本大）、吉沢明康（京都大）、田畑剛（京都大）、岩崎未央（京都大）、杉山直幸（京都大）、田中聡（Trans-IT）、石濱泰（京都大）
※氏名の前の「○」は、代表発表者であることを表します。
DOI
概要
jPOSTではプロテオームの質量分析データを登録するためのリポジトリ（https://repository.jpostdb.org/）を2016年より運用している。既に716プロジェクトが登録されており、これらの利用を促進し高度化する機能を追加した。
- (1) HUPO-PSIが提唱するデータ横断検索仕様PROXIに準拠したAPIの開発とリポジトリに登録済みデータのUSI (Universal Spectrum Identifier) 化。
- (2) 新しい質量分析のソフトウェアやフォーマットで出力されたファイルに対応。受け入れ可能なデータを広げた結果、クロスリンキング質量分析や再解析後のデータの検証・受入れが可能となった。
- (3) JPDMで必要なメタデータ情報を自動作成する機能。JPDM (Journal of Proteome Data and Medhots) は2019年に創刊されたプロテオームのデータジャーナルであり、JPDMへの論文投稿とメタデータの質向上に貢献する。
- (4) 公開済みデータをNBDCアーカイブに自動で移動する仕組み。これによりデータアクセスの利便性もより向上している。
発表資料
- jPOSTリポジトリの機能強化（PDF：1.50MB）
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