国立研究開発法人 科学技術振興機構
ポスター発表

【44】KusakiDB v1.0: New protein database of orthologous genes in plant species

発表者

○ゲルフィアンドレア(かずさ研)、中村保一(遺伝研)、磯部祥子(かずさ研)

※氏名の前の「○」は、代表発表者であることを表します。

DOI

doi:10.18908/togo2020.p044

概要

KusakiDB is a database of protein orthologous groups (OGs) that provides an assessment and management tool for comparison of OGs in plant species. KusakiDB correlates the information of three important databases, OrthoDB, UniProt and RefSeq. It introduces a validation tag that is based on the existence of at least one protein in each OG which is an attempt to address the problem of error propagation. KusakiDB was used as a database to re-annotate all species in Plant GARDEN (https://plantgarden.jp/ja/index).

発表資料

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