【46】植物・食品メタボローム解析メタデータのRDF化および測定生データの再解析に向けて
発表者
○長崎英樹（理研）、大澤祥子（かずさ研）、荒武（京都大）、福島敦史（理研）、高橋みき子（理研）、小林紀郎（理研）、櫻井望（遺伝研）、平川英樹（かずさ研）、有田正規（遺伝研）
※氏名の前の「○」は、代表発表者であることを表します。
DOI
概要
多様な代謝物の同定を行うメタボローム解析は、手法、解析機種、その設定も多種多様でそれらを収めたメタデータも複雑になる。統合化推進プロジェクトにおいて我々はメタボローム解析メタデータのResource Description Framework (RDF) というデータ形式でのアーカイブ化を計画している。RDFはデータに意味や属性を持たせるため、複雑なメタボロームのメタデータも検索等のデータ処理が容易になる。
かずさDNA研究所で所有するメタボローム解析メタデータは植物、食品の104プロジェクト、1,466サンプルでデータベース化されMetabolonote（https://metabolonote.kazusa.or.jp）として公開されてきたが、登録者の利便性を図って一部自由書式で登録されている。このため我々は改めてデータの意味付け、関連付けを人の目を介してRDF化を行った。
また、そのメタデータの測定生データは解析してから数年たつものが含まれているので、再解析を計画しているが、植物由来の生データだけでも数にして約2,700あるため、PowerGetBatch (Sakurai and Shibata, 2017) 等のソフトウェアをスーパーコンピュータ上で稼働させるなど効率化を図っている。
発表資料
- 植物・食品メタボローム解析メタデータのRDF化および測定生データの再解析に向けて（PDF：2.28MB）
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