ポスター発表
【19】公共NGSデータとその関連データの検索（2020年版）：SRA/BioProject/BioSample
発表者
○仲里猛留（DBCLS）、大田達郎（DBCLS）
※氏名の前の「○」は、代表発表者であることを表します。
DOI
概要
次世代シーケンサー（NGS）のデータは、NCBI/EBI/DDBJによって収集され、公共データベースSRAとして提供されている。SRAの公開が始まって10年以上が経ち、現在は約27万のプロジェクトのもと、17P baseのデータが格納されている（https://trace.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/sra/）。その間、ロングリードなどの新しいタイプのシーケンサーの誕生や、GEOなどの他のデータベースとの連携のためのBioProject/BioSampleの公開など、さまざまな拡張・変更を経てきた。ライフサイエンス統合データベースセンター（DBCLS）では、これらに対応するためにDDBJと連携して公共NGSデータ検索サイトのリニューアルを行っている。 新しい検索サイトはSRAだけでなくBioProjectやBioSampleの検索も行うことができる。また検索APIも提供しており、プログラムからの検索結果の取得も可能である。
発表資料
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