【16】DDBJサービス

発表者

○時松敏明（遺伝研）、青野英雄（遺伝研）、李慶範（遺伝研）、飯塚朋代（遺伝研）、大城戸利久（遺伝研）、川添将仁（遺伝研）、児玉悠一（遺伝研）、小菅武英（遺伝研）、杉田里江（遺伝研）、鈴木紀美子（遺伝研）、高木佳苗（遺伝研）、秦千比呂（遺伝研）、福田亜沙美（遺伝研）、真島淳（遺伝研）、横山会美（遺伝研）、藤澤貴智（遺伝研）

※氏名の前の「○」は、代表発表者であることを表します。

DOI

doi:10.18908/togo2020.p016

概要

DDBJは、30年以上にわたりNCBIおよびEBIと国際塩基配列データベース（INSDC）を協同運営し、遺伝研スーパーコンピュータを基盤として国内外の生命科学研究から産み出されるデータの登録・共有・解析サービスを提供している。遺伝研スパコンは、昨年三月に一新し、ゲノム解析環境の強化（Singurarityコンテナおよび個人ゲノム解析対応区画）、データサイズの増加に対応する階層ストレージを導入したが、今年4月に、計算ノード数を増やすことでさらにシステムを増強した。DDBJが運営するサービスは、アノテーションを付与/アセンブルした塩基配列データ:DDBJ、次世代シークエンスデータ:DRA、機能ゲノミクスデータ:GEA、アクセス制限のある個人ゲノムデータ:JGA、研究プロジェクト・サンプルのデータ:BioProject・BioSampleがあり、さらにメタボロームレポジトリ:MetaboBankおよびヒトバリエーションデータベース:JVarが加わる予定である。DDBJは生命科学研究の基盤となるためのデータベースを維持・強化しつづけている。

発表資料

• DDBJサービス（PDF：1.46MB）