【37】メタボローム統合データベースMetaboBankの開発
発表者
○長崎英樹（かずさ研）、○荒 武（かずさ研、京都大）、大澤祥子（かずさ研）、福島敦史（理研）、高橋みき子（理研）、小林紀郎（理研）、藤澤貴智（遺伝研）、時松敏明（遺伝研）、櫻井 望（遺伝研）、金谷重彦（奈良先端科学技術大学院大）、平川英樹（かずさ研）、有田正規（理研、遺伝研）
※氏名の前の「○」は、代表発表者であることを表します。
DOI
概要
多様な代謝物をより多く同定することを目指すメタボローム解析は、分析装置、解析手法、その設定も多種多様である。このため実験データだけでなく、実験手法を記載したメタデータも複雑化しており、世界的にデータの標準化が遅れている。我々は、公共リポジトリMetaboBankにおけるメタボローム解析メタデータをResource Description Framework (RDF) というデータ形式でアーカイブ化を行っている。現在かずさDNA研究所（KDRI）と理化学研究所（理研）にて測定された、植物を対象とした151プロジェクト、8,839サンプルの解析メタデータを対象にRDFのデータモデルを作成している。また他の生物種や実験条件にもデータモデルを拡張中である。
今後は奈良先端大のKNApSAcKなど他のメタボローム関連データベースやKDRIのPlant GARDENなどゲノム情報関連のデータベースとRDFを介して連携し、より多く、多様なデータの検索と解析を計画している。現在、KDRIと理研の生データ再解析を行なっており、これらの再解析結果もMetaboBankのプロジェクトとしてアーカイブ化の予定である。
発表資料
- メタボローム統合データベースMetaboBankの開発（PDF：4.32MB）
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