【6】DDBJ Workflow Execution Service

発表者

○大田達郎（DBCLS）、末竹裕貴（東京大）、丹生智也（遺伝研）、児玉悠一（遺伝研）、藤澤貴智（遺伝研）、小笠原 理（遺伝研）、清水厚志（遺伝研）、有田正規（遺伝研）

※氏名の前の「○」は、代表発表者であることを表します。

DOI

doi:10.18908/togo2021.p006

概要

DDBJでは国内の生命科学データ解析をサポートするため、共用のスーパーコンピューターシステム（DDBJスパコン）を提供している。さらに、センシティブなデータを取り扱うための個人ゲノム解析環境を有償で提供している。DDBJスパコンでは、生命科学データ解析でよく用いられるコマンドラインソフトウェア（ツール）をSingularityコンテナで提供するなど、各ユーザになるべく負担をかけずに解析を実行できるようサポートしている。しかし、データ解析では目的に応じてツールを組み合わせたワークフローを構築することが一般的であり、この作業はユーザらに委ねられている。そのため、ワークフローを共有する仕組みを作ることで、ユーザの負担はさらに軽減できるものと考えられる。DDBJではワークフローの共有と実行を簡易に行うことのできるDDBJ WESを開発している。DDBJ WESを用いることにより、一般的なワークフロー言語を用いて構築されたワークフローを使ったデータ解析を容易に行うことができる。

発表資料

• DDBJ Workflow Execution Service（PDF：2.81MB）