統合データベース講習会:AJACS駿河

AJACS駿河ポスター

統合データベース講習会は、生命科学系のデータベースやツールの使い方、データベースを統合する活動を紹介する講習会です。
今回の講習会では1日目に生命科学系データベースのカタログ、横断検索、アーカイブの使い方や生命科学系の主要なデータベース(DDBJ:DNA Data Bank of Japan、PDBj:Protein Data Bank Japan、KEGG: Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)の使い方について、また、DDBJパイプライン、遺伝子発現データベースや解析ツールをご紹介します。2日目には、PubMedを使って論文を検索したり、ダウンロードした論文の整理、論文中の略語の意味検索の仕方、創薬研究につながるバイオインフォマティクスの事例やKNApSAcKファミリーデータベースの使い方をご紹介します。参加者全員がハンズオンでコンピュータを使いながらの講習です。

  • 対象: 生命科学分野のデータベースを利用したい、研究に役立てたい方。
  • 日時: 2013年1月12日(土) 9:00~18:00、13日(日) 9:00~15:10
  • 定員: 50名
  • 費用: 無料
  • PC:  会場備え付けのPC(Windows Vista)をご使用いただきます。
  • 申込:  申し込み受付は終了しました。たくさんのご応募ありがとうございました。

  • プログラム  講習資料はこちらのサイトをご覧ください。

1月12日(土)

9:00~10:20  「NBDCの紹介とNBDCが提供するサービス」/ 高祖歩美(科学技術振興機構 バイオサイエンスデータベースセンター)

10:20~10:30 休憩

10:30~12:30 「主要なDB(DDBJ、PDBj、KEGG)の使い方」/ 中村保一(情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所)

12:30~13:30 昼食

13:30~15:00 「DDBJパイプラインによる高速シーケンスデータ解析」/ 中村保一(情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所)

15:00~15:10 休憩

15:10~18:00 「遺伝子発現DB・解析ツールの紹介」/河野信(情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター)

1月13日(日)

9:00~10:00  「文献の検索とその整理方法」/ 河野信(情報・システム研究機構 ライフサイエンス総合データベースセンター)

10:00~10:10 休憩

10:10~12:10 「創薬につながるバイオインフォマティクス」/ 水口賢司(医薬基盤研究所 バイオインフォマティクスプロジェクト)

12:10~13:10 昼食

13:10~15:10 「KNApSAcKファミリーデータベースの利用方法:医食同源、食品からのメタボロミクス!」 
/ 金谷重彦 (奈良先端科学技術大学院大学 情報科学研究科)

  • お問い合わせ: 統合データベース講習会事務局  までメールにてお問い合わせください。

  • 主催: 科学技術振興機構 バイオサイエンスデータベースセンター(NBDC)
  • 共催: 大学共同利用機関法人 情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター(DBCLS)
        静岡県立大学
        医薬基盤研究所
        日本DNAデータバンク(DDBJ)

※AJACS(「あじゃっくす」と発音)とは・・・
ライフサイエンス分野のデータベース統合を担う人材、アノテーター(Annotator)、キュレーター(Curator)、システムデータベース管理者(System DB administrator)の総称です(All Japan Annotator/Curator/System DB administrator)。AJACSな人は、統合データベースの作成、維持、管理にかかわる新たな職種です。
文部科学省委託研究開発事業「統合データベースプロジェクト」(平成18年度~平成22年度)においては、主としてライフサイエンス統合データベースセンター(DBCLS: Database Center for Life Science)を担う人材として期待されてきました。平成23年度からは講習会等も新たな体制で実施されることになり、より幅広く活躍できるAJACSが生まれることを願っています。

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