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カテゴリー
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用途・サービス名称
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サービス
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概要
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データベース統合
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生命科学のデータベース情報を取得
Integbioデータベースカタログ
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国内外のRDFデータをSPARQLで検索
RDFポータル
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国内外のデータベースをREST APIで検索・取得・形式変換・RDF化
TogoWS
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表形式の独自データベースをSPARQL検索
TogoDB
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データベース（DB）のID間の対応関係をREST APIで変換
TogoID
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ヒト
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日本人ヒトゲノムのバリアントをSPARQLで検索
TogoVar
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遺伝子発現情報、転写開始点情報をSPARQLで検索（ヒト・マウス）
DBKERO
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ゲノム
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ゲノム・生物種・表現型・環境の情報をウェブアプリで再利用
TogoGenome
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REST APIでゲノムを配列で高速に検索
GGGenome
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遺伝子
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REST APIで遺伝子を配列やキーワードで検索
GGRNA
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疾患関連遺伝子をREST API でエンリッチメント解析
Gendoo
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遺伝子発現
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遺伝子発現の実験データセットをREST APIで検索
AOE
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NGS
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NGSの生データをREST APIで検索
DBCLS SRA
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タンパク質
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蛋白質立体構造をSPARQLで検索
PDBj
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プロテオーム
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プロテオーム実験データをSPARQLで検索
jPOSTdb
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グライコーム
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糖鎖関連情報のSPARQLで検索
GlyCosmos Portal
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疾患
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希少・難治性疾患の関連情報をSPARQLで検索
PubCaseFinder
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自然言語処理
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論文などのテキストのアノテーションを検索
PubAnnotation / TextAE
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テキストマイニングに用いる辞書を検索
PubDictionaries
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論文に使われる英文表現をREST APIで検索
inMeXes
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論文に使われる略語をSPARQLで検索
Allie RDF Data Portal
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論文の引用関係とコンテクストをSPARQLで検索
Colil RDF Data Portal
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ライフサイエンス辞書をSPARQLで検索
LSD RDF Data Portal
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RDF 作成
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RDBデータベースをGUIで設定してRDF化
D2RQ Mapper
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JSONデータをJSON-LDに変換してRDF化
JSON2LD Mapper
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RDFデータを空白ノードを破綻させずに複数のファイルに分割
split4blank
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データベースをRDF化する際の指針
RDF化ガイドライン
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SPARQL検索
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国内外のSPARQLエンドポイントの評価を閲覧
Umaka-Yummy Data
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RDFデータの構造を可視化
Umaka Viewer
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SPARQLの検索結果を可視化し任意のウェブページで再利用
TogoStanza
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SPARQLの検索結果をJavaScriptでカスタマイズして可視化
d3sparql.js
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複雑なSPARQLクエリをREST APIとして公開・再利用
SPARQList
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複雑なSPARQLクエリをコマンドラインで実行
SPANG
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SPARQLエンドポイントをGUIでインタラクティブに探索
Endpoint browser
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SPARQLエンドポイントをGUIでクラス関係から検索
SPARQL Builder
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SPARQLエンドポイントをSPARQL入力支援で検索
SPARQL support
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SPARQLエンドポイントをGraphQLで検索
Grasp
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SPARQLエンドポイントを効率化して安全に公開
SPARQL-proxy
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RDFのデータモデルを定義してSPARQLクエリや可視化を自動生成
RDF config
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