【3】TogoID: データベース統合の基盤となるID変換サービス

発表者

○池田秀也（DBCLS）、千葉啓和（DBCLS）、藤原豊史（DBCLS）、原薗陛正（NBDC）、井手隆広（NBDC）、片山俊明（DBCLS）、川島秀一（DBCLS）、箕輪真理（DBCLS）、三橋信孝（DBCLS）、守屋勇樹（DBCLS）、内藤雄樹（DBCLS）、仲里猛留（DBCLS）、信定知江（NBDC）、大田達郎（DBCLS）、小野浩雅（DBCLS）、申在紋（DBCLS）、鈴木拓真（NBDC）、高月照江（DBCLS）、建石由佳（NBDC）、豊岡理人（NBDC）、山本泰智（DBCLS）、八塚 茂（NBDC）

※氏名の前の「○」は、代表発表者であることを表します。

DOI

doi:10.18908/togo2021.p003

概要

TogoID（https://togoid.dbcls.jp/）は、生命科学分野におけるデータベース (DB) のID間の変換を行うことができるWebアプリケーションである。
遺伝子、タンパク質、化合物、疾患、遺伝子多型といった幅広いカテゴリーに渡る62種（2021年7月時点）のIDを対象としている。カテゴリー内でのIDの変換のみならず、関連する他のカテゴリーのIDへの変換も可能である。ID間の意味的な関係はRDFで表現することを目指している。
Webインタフェース上では、変換されたIDをクリップボードへ直接コピーしたり、変換前後のID対応の一覧をCSV形式でダウンロードしたりすることができる。またAPIも提供しており、他のアプリケーションからのID変換にも利用することができる。
ID間の対応関係は、各DBのRDFデータ、API、フラットファイルからの抽出によって整備しており、GitHubレポジトリ（https://github.com/dbcls/togoid-config）で管理･公開している。対象DBのIDに関するメタデータや、IDペアの更新方法、頻度などを管理することで、最新のID間の対応関係を得られるようにしている。
ID間の対応関係を整備することはDB統合の基本であり、本サービスはDB間をまたいだ知識発見の基盤となるものである。

発表資料

• TogoID: データベース統合の基盤となるID変換サービス（PDF：1.66MB）