日本人ゲノム多様性統合データベース「TogoVar」スタート!【データベースを学べるNBDCメルマガ】

2018年6月21日

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本メールマガジンは1ヶ月に1回程度、科学技術振興機構(JST)バイオサイエンスデータベースセンター(NBDC)のイベントにご参加いただいた方、およびNBDCメルマガにご登録いただいた方にお送りしています。

こんにちは。NBDCメルマガ編集担当です。
生命科学分野におけるデータ/データベースの利活用法を学べるイベント情報や、研究データの共有をめぐる国際動向など、研究者・技術者・研究管理者の皆様に役立つ情報をお届けします。
どうぞよろしくお願い申し上げます。

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■ 新着情報
  新サービス「TogoVar」公開しました
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日本人ゲノム多様性統合データベース「TogoVar」の運用を開始しました。
https://togovar.biosciencedbc.jp

「TogoVar」(トーゴーバー)は、国内外のデータベースにおけるバリアントの頻度情報やアノテーション情報、そして既報論文を、ワンストップで取得できるWebサービスです。
検索対象には、NBDCヒトデータベースに登録された日本人のゲノムデータから集計した大規模なバリアントの頻度情報が含まれており、この頻度情報のデータセットもTogoVarから公開されています。
誰でも無料でお使いいただけます。ぜひお試しください。

詳細な機能はプレスリリースからご確認ください。
http://www.jst.go.jp/pr/announce/20180607/index.html

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■ イベント
  AJACS筑波4を物質・材料研究機構にて開催(7/10)
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生命科学系のデータベースやツールの使い方、データベースを統合する活動を紹介する初心者向けの講習会「AJACS講習会」。
次回は、茨城県つくば市の物質・材料研究機構(NIMS)で開催いたします。
参加申し込みの締め切りは / 7月2日(月)12:00 / です。

■統合データベース講習会:AJACS筑波4
【開催日】2018年7月10日(火)
【会 場】物質・材料研究機構 千現地区(茨城県つくば市千現1-2-1)
【参加費】無料
【定 員】約50名
【講習内容】
 -「NBDCの紹介とNBDCが提供するサービス」
 -「ゲノムデータベースとそれを活用した配列解析入門」
 -「化合物データベース」
 -「タンパク質立体構造データベース(PDBj)」

参加申し込みはこちらから
https://events.biosciencedbc.jp/training/ajacs70

●8月29日にはJST東京本部(市ヶ谷)にて開催予定です。
詳細は決まり次第お知らせいたします。
https://events.biosciencedbc.jp/training/application/results2018/

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■ イベント
  トーゴーの日シンポジウム2018(10/5)
  ポスター発表募集中
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ライフサイエンス分野のデータ統合にまつわる問題をともに考え、議論を深めるため、NBDCは毎年10月5日を「トーゴーの日」として、シンポジウムを開催しています。
今年も10月5日(金)に、日本科学未来館において、
「トーゴーの日シンポジウム2018 ~バイオデータベース:つないで使う~」を開催します。
少し先の話ですが、ぜひ手帳の10月5日にメモをどうぞ!

当日の【ポスター発表】をただいま募集中です。
締め切りは / 7月20日(金)12:00 / です。
多くの応募をお待ちしております。
https://events.biosciencedbc.jp/sympo/togo2018/poster

■トーゴーの日シンポジウム2018 ~バイオデータベース:つないで使う~
【開催日】2018年10月5日(金)10:00~17:50(予定)
【会 場】日本科学未来館 7階(東京都江東区)
【参加費】無料
※参加登録は8月ごろから開始予定です。

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■ NBDC最新記事
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6月から「NBDCブログ」を始めました。
データベース構築・利活用に関する実施事例やTips、生命科学分野のホットな話題に関する簡単な解説など、NBDCスタッフ書き下ろしの記事をお届けしていきます。

■『あなたのデータは「よそ行き」ですか?』
https://biosciencedbc.jp/nbdc-blog/981-20180606-02

あなたの研究から生まれた貴重なデータ。
リポジトリで公開することが、当たり前になりつつありますね。
でもそのデータ、「普段着」のままで公開して大丈夫ですか?
利用者に理解しやすいデータに整理して、研究の価値を高めましょう。

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■ 編集後記
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●6月7日に「TogoVar」が公開されました。
開発担当者は直前までサービスの改善と記者会見の準備に奔走しましたが、無事公開を迎えてほっとしています。
今後は機能やデータベースを随時アップデートするとともに、開発者による詳しい使い方なども紹介していきたいと思います。お楽しみに!

●NBDCやNBDCがファンドしているサービスの活用事例を募集しています。
NBDCがデータベース環境整備事業を継続するために、論文、学会発表、発表スライド、寄稿記事など、皆さまがNBDCサービスを活用した成果を下記フォームより教えてください。
https://form.jst.go.jp/enquetes/nbdcexamples

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