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      •  RGP : A YAC-Based Rice Transcript Map Containing 6591 EST Sites[アーカイブデータ]
      •  RGP : RICE GENETIC MAP IN NATURE GENETICS[アーカイブデータ]
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 文献 

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  •  GeneReviews 日本語版サイト
  •  GeneReviews
  •  Genetics Home Reference (Conditions)
  •  Genetics Home Reference (Genes)
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  •  Genetics Home Reference (Handbooks)
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  •  健康づくりに向けた『食育』取組データベース
  •  日本核医学会学会誌
  •  東アジア伝統医学エビデンスレポート
  •  NIMG-PF
  •  国立健康・栄養研究所 産学連携提案テーマデータベース
  •  JACLiD
  •  BioStar
  •  SEQAnswers
  •  ライフサイエンスQA

 学会要旨 

  •  日本農芸化学会大会要旨
  •  日本生物物理学会大会発表要旨
  •  トーゴーの日シンポジウム要旨
  •  医学・薬学予稿集全文データベース

 特許関連文書 

     日本国特許 

    •  日本国特許(平成16年_2004年)
    •  日本国特許(平成17年_2005年)
    •  日本国特許(平成18年_2006年)
    •  日本国特許(平成19年_2007年)
    •  日本国特許(平成20年_2008年)
    •  日本国特許(平成21年_2009年)
    •  日本国特許(平成22年_2010年)
    •  日本国特許(平成23年_2011年)
    •  日本国特許(平成24年_2012年)
    •  日本国特許(平成25年_2013年)
    •  日本国特許(平成26年_2014年)
    •  日本国特許(平成27年_2015年)

 用語解説 

  •  Gene Wiki
  •  Proteopedia
  •  Molecule of the Month
  •  船戸和弥のホームページ
  •  Gray’s Anatomy of the Human Body
  •  Wikiproject(MCB)
  •  researchmap
  •  学会名鑑
  •  New Natural Compounds purified in Antibiotics Lab, RIKEN
  •  wiki.jscpb.org - Who's Who
  •  医師法
  •  医薬品、医療機器等の品質、有効性及び安全性の確保等に関する法律
  •  国際化学物質安全性カード(ICSC)
  •  病気の解説 難病情報センター
  •  サイエンティストライブラリー特別編 ~日本の生命研究を築いた科学者~
  •  分子プローブライブラリー
  •  ClinicalTrials.gov
  •  RaDaP
  •  学名(ラテン語)と他言語での種名の対応
  •  生物名の学名と和名の対応
  •  学術用語の日本語と英語の対応
  •  解剖学用語の和英ラテン対応辞書 Terminologia Anatomica Japonica 第13版準拠
  •  biosharing.org
  •  MiFuP
  •  Allie

 ゲノム・遺伝子・RNA 

     ゲノム 

    •  Silver Project: Ape Genome Sequencing
    •  Comparative Genomic Hybridization Database
    •  KAIKOGAAS
    •  Swine Marker Viewer
    •  miyakogusa.jp
    •  SGD(Sugi Genome Database)
    •  RMG(Rice Mitochondrial Genome)
    •  Jatropha Genome Database
    •  KAOS
    •  Strawberry GARDEN
    •  KaTomicsDB(Tomato SBM DataBase)
    •  Carnation DB
    •  Escherichia coli O157:H7 Sakai
    •  V. parahaemolyticus Genome Information
    •  Streptococcus pyogenes
    •  Nocardia farcinica Genome Project Page
    •  Genome Project of Streptomyces avermitilis
    •  CyanoBase(Genome database for Cyanobacteria)
    •  RhizoBase(Genome database for Rhizobia with annotation)
    •  Mycoplasma penetrans Genome
    •  MBGD(Microbial Genome Database for Comparative Analysis)
    •  BSORF(Bacillus subtilis Genome Database)
    •  PEC(Profiling of E. coli Chromosome)
    •  Extremo Base(Genome Sequences Analyzed by JAMSTEC)
    •  DOGAN(a genome database of microorganisms sequenced at NITE)
    •  Schizosaccharomyces pombe Postgenome Database
    •  TOT-DB
    •  KEGG GENOME (Organisms and ecosystems with genome sequence information)
    •  A web-based comparative genome browser between human and other vertebrate genomes (G-compass)
    •  DBGET Search - DGENES
    •  Codon Usage Database

     遺伝子・転写産物 

    •  Evola(Evolutionary annotation database)
    •  GGDB(GlycoGene Database)
    •  H-InvDB(H-Invitational Database)
    •  RefSeq(Reference Sequence)
    •  NEDO database(New Energy and Industrial Technology Development Organization Database)
    •  H-DBAS(Human-transcriptome DataBase for Alternative Splicing)
    •  FLJ Human cDNA Database
    •  Gene(Entrez Gene Human)
    •  FANTOM4(Functional Annotation of the Mammalian Genome)
    •  HGPD(Human Gene and Protein Database)
    •  KEGG GENES Database (Molecular building blocks of life in the genomic space)
    •  CDT-DB
    •  FANTOM3(Functional Annotation of Mouse 3)
    •  Gene(Entrez Gene Mouse)
    •  ROUGE(A Database of Rodent Unidentified Gene-Encoded Large Proteins Analyzed by Kazusa Mouse cDNA Project)
    •  EGTC(Database for the Exchangeable Gene Trap Clones)
    •  XDB
    •  JDD(Japan Drosophila Database)
    •  CiAID
    •  FANTOM5
    •  植物遺伝子材料カタログ
    •  Bombyx Trap DataBase
    •  Malaria Full-Length cDNA Database (Plasmodium falciparum)
    •  GenoBase ver.6[アーカイブデータ]
    •  Hepatitis Virus Database (Analysis results of hepatitis virus gene, lineage)
    •  DoBISCUIT
    •  MicrobeDB.jp
    •  RAP-DB(Rice Annotation Project DataBase)
    •  KOME(Knowledge-Oriented Molecular Biological Encyclopedia)
    •  KATANA(Kazusa Arabidopsis thaliana Annotation Abstract)
    •  ChIP-Atlas
    •  PHYSCObase
    •  ED-Genes
    •  ARTADE
    •  RAPID
    •  Transposon tag line Database Search
    •  SoybeanTFDB
    •  TAB project(Transcription Analysis of BY-2)
    •  Q-TARO(QTL Annotation Rice Online database)
    •  RPG(Ribosomal Protein Gene Database)
    •  DBGET Search - VGENES

     多型 

    •  JSNP(Japanese Single Nucleotide Polymorphisms)
    •  GWAS(Genome Wide Association Study Database)
    •  KMDB/MutationView (Keio Mutation Databases)
    •  PharmGKB(Pharmacogenomics Knowledge Base)
    •  VarySysDB
    •  統合がんゲノムデータベース
    •  GeMDBJ(Genome Medicine Database of Japan)
    •  Comparative Genomic Hybridization Database
    •  RAvariome(Rheumatoid Arthritis variome)
    •  VaDE
    •  Polymorphism of Microsatellite Markers
    •  IDMPD-BJ
    •  MMDBJ(Mouse Microsatellite Data Base of Japan)
    •  VegMarks(a DNA marker database for vegitables)
    •  Soybean Marker Database
    •  KaTomicsDB(Tomato Marker)
    •  KaTomicsDB(Tomato Functional SNP DataBase)

     機能RNA 

    •  snoOPY(snoRNA Orthological Gene Database)
    •  tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)
    •  fRNAdb(Functional RNA Database)

 遺伝子発現・転写制御 

     転写モチーフ 

    •  DBTGR(Database of Tunicate Gene Regulation)
    •  Riken Transcription Factor Database
    •  ATTED-II (Gene expression database of Arabidopsis coexpression)
    •  PPDB(PlantPromoterDB)
    •  PLACE(A Database of Plant Cis-acting Regulatory DNA Elements)
    •  RARTF
    •  DBTBS(A database of transcriptional regulation in Bacillus subtilis containing upstream intergenic conservation information)
    •  DBSCR
    •  S. cerevisiae OriDB
    •  S. pombe OriDB
    •  DBTSS(Database of Transcriptional Start Sites)

     EST 

    •  MAboya ( the ascidian, Halocynthia roretzi ) Gene Expression patterns and Sequence Tags
    •  SilkBase (EST analysis of silkworm gene expression)
    •  KAIKOcDNA
    •  Full-Anopheles
    •  MiBASE (Micro-Tom Database)
    •  PHYSCObase
    •  RGP(The Rice Genome Research Program)
    •  KaFTom
    •  Poplar Full-Length Clone Database Search
    •  Tobacco EST clones from BY-2 cells Database Search
    •  Physcomitrella patens Full-Length cDNA Clone Database Search
    •  RAFL cDNAs
    •  Porphyra yezoensis (susabinori) EST dataset
    •  RIKEN Arabidopsis Full-Length Clone Database Search
    •  RIKEN-CIAT Cassava Full-Length Clone Database Search
    •  KOMUGI
    •  Full-Cryptosporidium
    •  Full-Babesia
    •  Full-Echinococcosis
    •  Full-Tsetse
    •  Full-Toxoplasma
    •  NEXTDB
    •  ESTs of Lentinus edodes (shiitake mushroom)
    •  DBGET Search - EGENES

     マイクロアレイ 

    •  SBM Database(Systems Biology and Medicine Database)
    •  統合失調症の脳内遺伝子発現プロファイル
    •  Mouse DNA Microarray
    •  COXPRESdb
    •  RnR(Regulatory-network Research in Arabidopsis T87 cultured cells)
    •  AtGenExpress
    •  RED (Rice Expression Database)
    •  RED II INAHO (Rice Expression Database II INAHO)
    •  Transcriptome analysis of 2 component system in Eschericia coli
    •  MacroArray Analysis Page of Bradyrhizobium japonicum
    •  CIBEX(Center for Information Biology gene Expression database)
    •  CellMontage
    •  KEGG EXPRESSION Database

     SAGE, CAGE, ATAC-PCR, iAFLP等 

    •  CGED(Cancer Gene Expression Database)
    •  H-ANGEL(The Human Anatomical Gene Expression Library)
    •  BodyMap (Human and mouse gene expression database)
    •  CAGE

 タンパク質 

     配列・ファミリー・タンパク質総合 

    •  Hepatitis Virus Database (Analysis results of hepatitis virus gene, lineage)
    •  Deinococci Genome Database
    •  iProClass (An Integrated Protein Knowledgebase)
    •  AAindex(Amino acid indices, substitution matrices and pair-wise contact potentials)
    •  SEVENS database
    •  UniProt(The Universal Protein Resource)
    •  TPプレスリリース(研究)一覧
    •  Targeted Proteins Atlas
    •  PREIMS
    •  Advanced Technologies Atlas
    •  CaMPDB

     ドメイン・モチーフ・立体構造 

    •  PepBase
    •  VIPERdb (A database for icosahedral virus capsid structures)
    •  Neuraminidase Structure DB
    •  PDBj(Protein Data Bank Japan)
    •  GTOP(Genomes To Protein structures and functions)
    •  BMRB(Biological Magnetic Resonance Data Bank)
    •  3D Electron Microscopy (3D-EM) Data Navigator
    •  eProtS(Encyclopedia of Protein Structures)
    •  ProMode(A database of normal mode analyses on protein molecules with a full-atom model)
    •  ProTherm(Thermodynamic Database for Protein and Mutants)
    •  Biomolecules Gallery
    •  OLIGAMI(Oligomer Architecture and Molecular Interface)
    •  PDBePISA
    •  eF-site(electrostatic surface of Functional-site)
    •  Protein Globe
    •  Yorodumi 万見
    •  PDBSTR
    •  PDBWiki
    •  TP構造ギャラリー
    •  RIKEN Systems and Structural Biology Center
    •  DTA DATABASE
    •  KEGG MODULE
    •  PoSSuM

     機能・局在 

    •  TMIG-2DPAGE Proteome Database
    •  KOP
    •  Mouse Basement Membrane Bodymap
    •  LfDB(Lectin Frontier Database)
    •  GlycoPOD(GlycoScience Protocol Online Database)
    •  DBGET Search - ENZYME
    •  RPG(Ribosomal Protein Gene Database)
    •  PMD(Protein Mutant Database)
    •  EzCatDB(A Database of Enzyme Catalytic Mechanisms)
    •  HATODAS2
    •  Autophagy Database
    •  3DPL

     発現 

    •  eSOL(Solubility database of all E.coli proteins)
    •  MassBank
    •  Two-Dimensional Electrophoresis Database of HSG cells proteins
    •  HGPD(Human Gene and Protein Database)
    •  SHOGoin
    •  Rice Proteome Database
    •  MassBase (A comprehensive mass spectral tags archive for plant metabolomics)

     相互作用 

    •  GLIDA(GPCR-Ligand Database)
    •  PCDq(Protein Complex Database with complex quality index)
    •  Genomic Object Net Pathway Database
    •  ProNIT(Thermodynamic Database for Protein-Nucleic Acid Interactions)
    •  Het-PDB Navi(A navigator of small molecules in Protein Data Bank which is called heterogen atoms or in short hetatoms)
    •  SPAD(Signaling Pathway Database)
    •  HINTdb(Homologous Interactions Database)
    •  HitPredict (A database of high confidence protein-protein interactions)
    •  PPI view(Protein-Protein Interaction viewer)
    •  PiSITE - 蛋白質の相互作用部位データベース

 パスウェイ・相互作用・生体反応 

  •  COXPRESdb
  •  GLIDA(GPCR-Ligand Database)
  •  Genome Network Platform
  •  DDIDA
  •  CancerProView
  •  Ascidians Chemical Biological Database
  •  KEGG PATHWAY Database (Wiring diagrams of molecular interactions, reactions, and relations)
  •  KEGG REACTION (Knowledge base for predicting biodegradation and biosynthesis)
  •  KEGG COMPOUND (Metabolome informatics resource integrating genomics and chemistry)
  •  DBGET Search - RPAIR
  •  Genomic Object Net Pathway Database
  •  SPAD(Signaling Pathway Database)
  •  KaPPA-View 4(Kazusa Plant Pathway Viewer)
  •  Motorcycle
  •  MS-MS Fragment Viewer
  •  MassBank
  •  CoP
  •  KomicMarket
  •  KEGG RCLASS

 糖・脂質 

  •  KEGG GLYCAN (Glycome informatics resource integrating genomics and chemistry)
  •  GGDB(GlycoGene Database)
  •  LfDB(Lectin Frontier Database)
  •  GALAXY (Glycoanalysis by the three axes of MS and chromatography)
  •  Glycoepitope Antibody
  •  Glycoepitope General
  •  Glycoepitope GlycoLipid
  •  Glycoepitope GlycoProtein
  •  GlycoForum
  •  Glycoconjugate Data Bank(Glycoconjugate Data Bank)
  •  GMDB(Glycan Mass Spectral DataBase)
  •  LipidBank
  •  PACDB(Pathogen Adherence to Carbohydrate Database)
  •  GlycoPOD(GlycoScience Protocol Online Database)
  •  TuMaRDB(Tumor Markers Reference Databse)

 細胞・組織 

  •  免疫組織データベースいむーの
  •  JCRB Cell Bank(Japanese Collection of Research Bioresources Cell Bank)
  •  JCRB Gene Bank
  •  メディカルバイオリソースデータベース
  •  難病研究資源バンク
  •  National BioResource Project Human embryonic stem cells (ヒトES細胞プロジェクト情報公開ページ)
  •  病理コア画像
  •  SHOGoin
  •  SKIP 幹細胞情報データベース
  •  FABA(Four-dimensional Ascidian Body Atlas)
  •  JCRB Cell Bank(Japanese Collection of Research Bioresources Cell Bank)
  •  JCRB Gene Bank
  •  メディカルバイオリソースデータベース
  •  実験動物研究資源バンク
  •  BRC 細胞 リソース
  •  BRC マウス リソース
  •  ANIMAL SEARCH SYSTEM (マウス系統検索)
  •  XenoBiores: ナショナルバイオリソースプロジェクト 「ネッタイツメガエルの近交化・標準系統の樹立・提供」のWEBサイト
  •  日本で維持されている可移植性腫瘍株一覧表
  •  Silkworm Base (Silkworm Genetic Resource Database)
  •  Experimental Animal Database Search
  •  NBRP-Rat
  •  Mouse Genetic Resources
  •  GAIN
  •  National BioResource Project Zebrafish
  •  Flybrain NDB
  •  CITRES
  •  RefDIC
  •  PODB2(Plant Organelles Database 2)
  •  植物培養細胞カタログ
  •  RIKEN BRC Arabidopsis activation (T-DNA)-tagged lines
  •  SASSC Quick search
  •  TOMATO (National BioResource Project)
  •  TOMATOMA (Tomato Mutants Archive)
  •  KU-MACC
  •  アサガオホームページ
  •  BARLEY DB
  •  Algae Resource Database
  •  NBRP Chrysanthemum
  •  LIPS
  •  The Plant Organelles Database 2 Organelles Movie Database
  •  SCMD(Saccharomyces cerevisiae Morphological Database)
  •  NBRP Nenkin
  •  微生物系統保存施設
  •  RIKEN BRC Japan Collection of Microorganisms
  •  保有糸状菌株リスト
  •  National BioResource Project Bacillus subtilis
  •  NBRP E.coli Strain (The Cloning Vecter Collection)
  •  NBRC Culture Catalogue Search
  •  RIKEN BRC CELL BANK

 発生 

  •  3D MR Microscopic Images of Kyoto Collection of Human Embryos
  •  Mouse Basement Membrane Bodymap

 医療・薬 

     医学 

    •  メルクマニュアル
    •  メルクマニュアル家庭版
    •  PDQ日本語版(専門家向け)
    •  がん情報サイト (Cancer Information Japan)
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     歯学 

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     薬学 

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    •  希少疾病用医薬品・希少疾病用医療機器
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    •  副作用情報データベース-動物医薬品検査所
    •  伝統医薬データベース
    •  医薬品、医療機器等の品質、有効性及び安全性の確保等に関する法律
    •  医薬品情報データベース
    •  生物学的製剤基準
    •  3DPSD: 3次元医薬品構造データベース
    •  DDIDA

     解剖 

    •  BodyParts3D
    •  船戸和弥のホームページ
    •  Gray’s Anatomy of the Human Body
    •  病理コア画像

 食品・栄養 

  •  Food Composition Database (食品成分データベース)
  •  食品機能成分データベース
  •  「健康食品」の素材情報データベース
  •  HACCP関連情報データベース
  •  食品照射データベース
  •  Dr.Supplement
  •  毒きのこデータベース
  •  KNApSAcK Family DietNavi
  •  食品添加物ADI関連情報データベース
  •  健康食品の安全情報・被害関連情報
  •  健康食品の安全性・有効性情報の基礎知識
  •  話題の食品・成分

 農学・環境 

     農業・食料 

    •  食品害虫サイト (貯穀害虫・天敵図鑑)
    •  イネ品種・特性データベース検索システム
    •  VegMarks(a DNA marker database for vegitables)
    •  KNApSAcK (A Comprehensive Species-Metabolite Relationship Database)
    •  KNApSAck Family
    •  The Rice Growth Monitoring System
    •  日本植物病名データベース
    •  農業生物資源ジーンバンク:植物画像データベース
    •  農薬等ADI関連情報データベース
    •  Kyushu University Rice Database
    •  APASD(Asian-Pacific Alien Species Database)

     獣医・畜産 

    •  家畜の監視伝染病
    •  NIAH 病理アトラス
    •  写真で見る家畜の有毒植物と中毒
    •  飼料作物病害図鑑 (Illustrated Encyclopedia of Forage Crop Diseases)
    •  写真で見る外来雑草
    •  畜産環境文献データベース
    •  農業生物資源ジーンバンク:動物画像データベース
    •  動物用医薬品データベース
    •  副作用情報データベース-動物医薬品検査所

     環境 

    •  侵入生物データベース (Invasive Species of Japan)
    •  The Global Biodiversity Information Facility in Japan
    •  水質浄化に利用可能な植物データベース
    •  栄養塩・クロロフィルデータベース
    •  ChemTHEATRE

 生物図鑑・分類 

     図鑑 

    •  水生生物情報データーベース
    •  食品害虫サイト (貯穀害虫・天敵図鑑)
    •  侵入生物データベース (Invasive Species of Japan)
    •  Japanese Ant Image Database (日本産アリ類画像データベース)
    •  Visual database of Primatology (サル学画像データベース)
    •  農業生物資源ジーンバンク:動物画像データベース
    •  VARIOUS MARINE INVERTEBRATES
    •  MCPA2
    •  ナショナルバイオリソースプロジェクト ニワトリ-ウズラ
    •  海棲哺乳類図鑑
    •  魚類写真資料データベース
    •  南半球の魚図鑑
    •  東シナ海・黄海のさかな
    •  NPOTDB
    •  貝類データベース
    •  MAK type database(Makino Herbarium Type Specimen Image Database)
    •  写真で見る家畜の有毒植物と中毒
    •  飼料作物病害図鑑 (Illustrated Encyclopedia of Forage Crop Diseases)
    •  写真で見る外来雑草
    •  薬用植物データベース
    •  農業生物資源ジーンバンク:植物画像データベース
    •  metabolomics.jp
    •  佐賀大学電子図書館 植物遺伝資源検索
    •  資源作物見本園
    •  やさい・くだもの百科
    •  Tohoku Univ. Brassica Seed Bank (Brassica 近縁種保存系統)
    •  アサガオ類画像データベース (MORNING GLORIES DATABASE)
    •  瀬戸内海海藻類標本データベース
    •  原生生物情報サーバ
    •  ウイルス図鑑
    •  Digital Atlas of Actinomycetes
    •  EPFDB (Entomopathogenic Fungi Database)
    •  毒きのこデータベース
    •  真菌・放射菌ギャラリー
    •  有孔虫研究会Database
    •  Biological Information System for Marine Life
    •  APASD(Asian-Pacific Alien Species Database)

     分類 

    •  KEGG BRITE(Functional hierarchies and binary relationships of biological entities)
    •  KEGG ORTHOLOGY (Linking genomes to pathways by ortholog annotation)
    •  ELKUType
    •  BGPlants
    •  AIIC(立川哲三郎博士寄贈寄生蜂類タイプ標本データベース TachikawaType)
    •  AIIC(中條道夫博士寄贈甲虫類タイプ標本データベース(M.ChujoType))
    •  AIIC(九州大学昆虫学教室所蔵ハナバチ類標本データベース(BeeELKU))
    •  AIIC(福田弘巳博士寄贈ハナバチ類標本データベース(BeeFukuda))
    •  AIIC(中央アジア産ハナバチ類標本データベース(BeeCAsia))
    •  AIIC(外国産ハナバチ類多田内標本データベース(BeeFTadauchi))
    •  AIIC(九州大学昆虫学教室所蔵寄生蜂類標本データベース(ProctELKU))
    •  AIIC(佐々治寛之博士寄贈甲虫類標本データベース(COLSasaji))
    •  AIIC(大塚勳氏寄贈熊本県産甲虫類標本データベース(COLOtsuka))
    •  AIIC(愛媛大学所蔵甲虫類標本データベース(COLEUMJ))
    •  水産食品の寄生虫検索データベース (D-PAF)